RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429859.5

CCDC18-AS1-208, CCDC18 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5

Gene CCDC18-AS1, Length 418 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MSANTD3Q96H12 275 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SPATA17Q96L03 361 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SLITRK1Q96PX8 696 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 B3GNT5Q9BYG0 378 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 DNAI2Q9GZS0 605 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 NACA2Q9H009 215 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 KIF9Q9HAQ2 790 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 FAM49BQ9NUQ9 324 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SMPD4Q9NXE4 827 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TRAF3IP3Q9Y228 551 aa7.54□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MIA3Q5JRA6 1907 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 IKBKBO14920 756 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 STX10O60499 249 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TADA3O75528 432 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 STAU1O95793 577 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 LMNAP02545 664 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CCDC130P13994 396 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ARSAP15289 507 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 YWHAQP27348 245 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CTHP32929 405 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PRCPP42785 496 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 RPS9P46781 194 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MXI1P50539 228 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PDE6CP51160 858 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CACNA2D1P54289 1103 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MAP3K7CLP57077 242 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 USP46P62068 366 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 NOP14P78316 857 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 AMPD2Q01433 879 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 GRSF1Q12849 480 aaKnown RBP eCLIP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TAF10Q12962 218 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ZACNQ401N2 412 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 WDR44Q5JSH3 913 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 HEATR6Q6AI08 1181 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 KLHL10Q6JEL2 608 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 C1orf228Q6PIY5 440 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TXNDC11Q6PKC3 985 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 FAM35AQ86V20 835 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 RALGPS2Q86X27 583 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CREBRFQ8IUR6 639 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 NUP93Q8N1F7 819 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CPA6Q8N4T0 437 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SLC2A14Q8TDB8 520 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SH3RF2Q8TEC5 729 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 EXOC4Q96A65 974 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SMARCD1Q96GM5 515 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 GSDMAQ96QA5 445 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SLC22A12Q96S37 553 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 KCNK16Q96T55 309 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SDCBP2Q9H190 292 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TRPV5Q9NQA5 729 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 KRT82Q9NSB4 513 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 FBXO4Q9UKT5 387 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 NME7Q9Y5B8 376 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CPQQ9Y646 472 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 WNT6Q9Y6F9 365 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 F5P12259 2224 aa7.53□□□□□ -1.2
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TRIM49BA6NDI0 452 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ARNTLO00327 626 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 BIN1O00499 593 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PSMA7O14818 248 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 RTN3O95197 1032 aaPredicted RBP7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 FAM163BP0C2L3 166 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 FAM200BP0CF97 657 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 IRF1P10914 325 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CHRNB1P11230 501 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CXCL12P48061 93 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CCR3P51677 355 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SLC5A3P53794 718 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PPP3CAQ08209 521 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 NR1H3Q13133 447 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PDGFRLQ15198 375 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 LPAL2Q16609 132 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 EDRF1Q3B7T1 1238 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CCDC40Q4G0X9 1142 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 DGKKQ5KSL6 1271 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 KRT39Q6A163 491 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 PRR23BQ6ZRT6 265 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 Q6ZS52 159 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 C12orf29Q8N999 325 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 SCAMP5Q8TAC9 235 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TAS1R2Q8TE23 839 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 TAF4BQ92750 862 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 ATP2A3Q93084 1043 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 CLDN23Q96B33 292 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 C8orf48Q96LL4 319 aa7.52□□□□□ -1.21
CCDC18-AS1-208ENST00000429859 MYRFLQ96LU7 910 aa7.52□□□□□ -1.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.4 ms