RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420886.6

SBNO1-202, Transcript of strawberry notch homolog 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SBNO1, Length 10,981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO1-202ENST00000420886 MAGEB16A2A368 324 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GOLGA8JA6NMD2 632 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CLDN25C9JDP6 229 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RAB25P57735 213 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 AUHQ13825 339 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DCLK2Q8N568 766 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TLCD1Q96CP7 247 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGEF26Q96DR7 871 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 APOPT1Q96IL0 206 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CDH19Q9H159 772 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PRKAG3Q9UGI9 489 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SEC24AO95486 1093 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF829Q3KNS6 432 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 EMC10Q5UCC4 262 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 POMGNT1Q8WZA1 660 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 AGBL1Q96MI9 1066 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 IGSF9Q9P2J2 1179 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 A0A0J9YVX5 310 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 LOC100653049A0A140TA62 436 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CLIC2O15247 247 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KRT34O76011 436 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PSMA2P25787 234 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 OSCP1Q8WVF1 389 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZBTB18Q99592 522 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CACYBPQ9HB71 228 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ARMCX1Q9P291 453 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FAM172BPA6NC97 362 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 DDX5P17844 614 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ME2P23368 584 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SLC5A3P53794 718 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 TXNRD1Q16881 649 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SMU1Q2TAY7 513 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GPR107Q5VW38 600 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CCDC81Q6ZN84 652 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FAR2Q96K12 515 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 JCADQ9P266 1359 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PROCP04070 461 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 RPL21P46778 160 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NSMFQ6X4W1 530 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PQLC1Q8N2U9 271 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FBXW8Q8N3Y1 598 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 POC5Q8NA72 575 aa6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZC3H7BQ9UGR2 993 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ATP9BO43861 1147 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 KATNA1O75449 491 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PCNAP12004 261 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ZNF23P17027 643 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SDE2Q6IQ49 451 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 STOX1Q6ZVD7 989 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UNC45BQ8IWX7 931 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PSMA8Q8TAA3 256 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SENP7Q9BQF6 1050 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 USP20Q9Y2K6 914 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ASB3Q9Y575 518 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SALL1Q9NSC2 1324 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ASS1P00966 412 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ABHD2P08910 425 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NAMPTP43490 491 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 OR2B2Q9GZK3 357 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 IFNA16P05015 189 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 NAT1P18440 290 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 HLA-DPA1P20036 260 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PSMC6P62333 389 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 AHI1Q8N157 1196 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ADCY4Q8NFM4 1077 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 ACCSQ96QU6 501 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 PSMD11O00231 422 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 UPP2O95045 317 aa6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 LDHBP07195 334 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
SBNO1-202ENST00000420886 CCND2P30279 289 aa6.69□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms