RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000415409.5

HDAC8-211, Transcript of histone deacetylase 8, humanhuman

TSL 5

Gene HDAC8, Length 913 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8-211ENST00000415409 RNASE9P60153 205 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 GRIK3Q13003 919 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 PDCLQ13371 301 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 PPP2R5EQ16537 467 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 LONRF2Q1L5Z9 754 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 C2CD6Q53TS8 623 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 C8orf74Q6P047 294 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 TMCO3Q6UWJ1 677 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 GLB1LQ6UWU2 654 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 AGMOQ6ZNB7 445 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 LRRC8DQ7L1W4 858 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ACOT1Q86TX2 421 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ECHDC2Q86YB7 292 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 RHOT1Q8IXI2 618 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 LINC00528Q8N1L1 170 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 TMEM86AQ8N2M4 240 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 NOA1Q8NC60 698 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 UBA3Q8TBC4 463 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 URGCPQ8TCY9 931 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 STK32AQ8WU08 396 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 CD101Q93033 1021 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 BTBD6Q96KE9 485 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 SENP8Q96LD8 212 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 RGS18Q9NS28 235 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 EHD2Q9NZN4 543 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 TSPAN16Q9UKR8 245 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 OGDHLQ9ULD0 1010 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 L1RE1Q9UN81 338 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 PCDHA3Q9Y5H8 950 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 MCM3APO60318 1980 aa7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 SIGLEC16A6NMB1 481 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 GOLGA8SH3BPF8 625 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 PSTPIP1O43586 416 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 LILRB3O75022 631 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 MYCP01106 439 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 FGGP02679 453 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 PDGFRBP09619 1106 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ODC1P11926 461 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 COL6A1P12109 1028 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 GABRB2P47870 512 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 PEX5P50542 639 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 CLCNKBP51801 687 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 BCAT1P54687 386 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 GSCP56915 257 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 TUSC3Q13454 348 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 MAP9Q49MG5 647 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 PTPN20Q4JDL3 420 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ODF2Q5BJF6 829 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 CYP4A22Q5TCH4 519 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 WDR93Q6P2C0 686 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 SLC24A5Q71RS6 500 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 METTL23Q86XA0 190 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 XYLT1Q86Y38 959 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 KLHL7Q8IXQ5 586 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ANKRD52Q8NB46 1076 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC26Q8TAB7 109 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 SPATA18Q8TC71 538 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 MAIP1Q8WWC4 291 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 SEPT8Q92599 483 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ALG3Q92685 438 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 KRT35Q92764 455 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 APBB2Q92870 758 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 MCEEQ96PE7 176 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 CPXM1Q96SM3 734 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 KRT12Q99456 494 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 OSBPL7Q9BZF2 842 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 EPC1Q9H2F5 836 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ARFGAP3Q9NP61 516 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 ST7Q9NRC1 585 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 FAM49BQ9NUQ9 324 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 MIOSQ9NXC5 875 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 KANSL3Q9P2N6 904 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 CYTH4Q9UIA0 394 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 DSEQ9UL01 958 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 RAB21Q9UL25 225 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 MTUS1Q9ULD2 1270 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 USTQ9Y2C2 406 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 DOCK3Q8IZD9 2030 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 MYH11P35749 1972 aa6.99□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa6.98□□□□□ -1.29
HDAC8-211ENST00000415409 CCDC151A5D8V7 595 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.1 ms