RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 L1RE1Q9UN81 338 aa20.71■□□□□ 0.91
HOXD12-201ENST00000404162 LEFTY2O00292 366 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 LAD1O00515 517 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM23O75077 832 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 GFPT1Q06210 699 aaPredicted RBP20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 EOGTQ5NDL2 527 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 SCARA3Q6AZY7 606 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ADALQ6DHV7 355 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 OSTM1Q86WC4 334 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 C12orf40Q86WS4 652 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 MYCT1Q8N699 235 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 FSIP1Q8NA03 581 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 CEP76Q8TAP6 659 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 PNKPQ96T60 521 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ODF2LQ9ULJ1 636 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 PLXNB3Q9ULL4 1909 aa20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 TCRBV21S2A2A0A5A6 115 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 MYMKA6NI61 221 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 HCRTO43612 131 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 SERPINF2P08697 491 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 HOXD12P35452 270 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 DHCR24Q15392 516 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 PNPLA1Q8N8W4 532 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA18Q8TC71 538 aa20.69■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 SH3BP5O60239 455 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 TRAK2O60296 914 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 KAT7O95251 611 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 APODP05090 189 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 TRIP6Q15654 476 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA2LQ8IUW3 424 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 KCTD17Q8N5Z5 321 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ADAMTS14Q8WXS8 1223 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF560Q96MR9 790 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 FIZ1Q96SL8 496 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 IKZF4Q9H2S9 585 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 MYOFQ9NZM1 2061 aa20.68■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 A0A0A0MRY4 1105 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGAP33O14559 1287 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 AP5Z1O43299 807 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 FAM13AO94988 1023 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 WNT7BP56706 349 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 GTF2BQ00403 316 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 MYL7Q01449 175 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 RPL6Q02878 288 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF33AQ06730 810 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 HNRNPDQ14103 355 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 RNF38Q9H0F5 515 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 DNAAF2Q9NVR5 837 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 AGAP1Q9UPQ3 857 aa20.67■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 HUS1O60921 280 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 SCP2P22307 547 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 POLR2BP30876 1174 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF131P52739 623 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 USP46P62068 366 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 KDSRQ06136 332 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 RHBDF2Q6PJF5 856 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 GPBP1Q86WP2 473 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 MDM1Q8TC05 714 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 PARVGQ9HBI0 331 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ARHGEF4Q9NR80 690 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 STYXL1Q9Y6J8 313 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 IGSF10Q6WRI0 2623 aa20.66■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 ITGB3P05106 788 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 FTH1P19P0C7X4 201 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 GABRG2P18507 467 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 PNPLA4P41247 253 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 TNFRSF4P43489 277 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 RESTQ13127 1097 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 SLC41A1Q8IVJ1 513 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 CPQQ9Y646 472 aa20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP20.65■□□□□ 0.9
HOXD12-201ENST00000404162 VWA3AA6NCI4 1184 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 ATP2C2O75185 946 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 GJB3O75712 270 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 GRIA2P42262 883 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 PDE6CP51160 858 aa20.64■□□□□ 0.89
HOXD12-201ENST00000404162 SLC7A9P82251 487 aa20.64■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.7 ms