RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SHKBP1Q8TBC3 707 aa16.2■□□□□ 0.18
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PGGT1BP2-201ENST00000398621 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.17■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BEST1O76090 585 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PTK2Q05397 1052 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BST2Q10589 180 aaKnown RBP16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TDGQ13569 410 aa16.16■□□□□ 0.18
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ARHGAP44Q17R89 818 aa16.16■□□□□ 0.18
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