RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393193.6

NME1-NME2-202, Transcript of NME1-NME2 readthrough, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene NME1-NME2, Length 1,021 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM122AQ96E09 287 aa17.37■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 CHFRQ96EP1 664 aa17.37■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 SHDQ96IW2 340 aa17.37■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 NIF3L1Q9GZT8 377 aa17.37■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 BRD9Q9H8M2 597 aa17.37■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYP3A43Q9HB55 503 aa17.37■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa17.37■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP17.37■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 GRIK1P39086 918 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 PPP1R2P41236 205 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ORC1Q13415 861 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 TPRG1Q6ZUI0 275 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 UBR7Q8N806 425 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 FBXL13Q8NEE6 735 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNIP3Q96KP6 325 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 CEP63Q96MT8 703 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 GCNAQ96QF7 691 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 KCNK16Q96T55 309 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 PHOX2BQ99453 314 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 TSG101Q99816 390 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM83CQ9BQN1 747 aa17.36■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 C2orf78A6NCI8 922 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 BIN1O00499 593 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 PMM2O15305 246 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 BEST1O76090 585 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 DCNP07585 359 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 P4HA1P13674 534 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 CCDC130P13994 396 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 TCF3P15923 654 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 CD72P21854 359 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZXDBP98169 803 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 USP4Q13107 963 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 TAF12Q16514 161 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 C12orf29Q8N999 325 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIML1Q8N9V2 468 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 BPIFB1Q8TDL5 484 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZFYVE19Q96K21 471 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMOQ99835 787 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARID3AQ99856 593 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 MMRN2Q9H8L6 949 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP17.35■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 11
NME1-NME2-202ENST00000393193 RAB20Q9NX57 234 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIAA1468Q9P260 1216 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 SIT1Q9Y3P8 196 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 MYOFQ9NZM1 2061 aa17.35■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF840PA6NDX5 716 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 HHLA1C9JL84 531 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF263O14978 683 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 MARSP56192 900 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZNF77Q15935 545 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 FRMD5Q7Z6J6 570 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 LMO3Q8TAP4 145 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 NELFBQ8WX92 580 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 TATDN2Q93075 761 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 SMARCD1Q96GM5 515 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 CYP2S1Q96SQ9 504 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 KIF9Q9HAQ2 790 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 HPS4Q9NQG7 708 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 TDP1Q9NUW8 608 aa17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP17.34■□□□□ 0.37
NME1-NME2-202ENST00000393193 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 H0Y858 1186 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 STX10O60499 249 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 OAS1P00973 400 aaKnown RBP17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ZDHHC11BP0C7U3 371 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PFKLP17858 780 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SNX30Q5VWJ9 437 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TXNDC11Q6PKC3 985 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC2A14Q8TDB8 520 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 IMPG2Q9BZV3 1241 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 KRT82Q9NSB4 513 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CTNND2Q9UQB3 1225 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PIAS3Q9Y6X2 628 aa17.33■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANXA13P27216 316 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 AVPR1AP37288 418 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 RPS9P46781 194 aaKnown RBP17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 FMO5P49326 533 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PGFP49763 221 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC5A3P53794 718 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 SLC7A9P82251 487 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 PLCB2Q00722 1185 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TNK2Q07912 1038 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TAF10Q12962 218 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 STIM1Q13586 685 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 ANGPT1Q15389 498 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CAMK4Q16566 473 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 KLHL10Q6JEL2 608 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 CLEC20AQ6ZU45 233 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 TRIM59Q8IWR1 403 aa17.32■□□□□ 0.36
NME1-NME2-202ENST00000393193 NUP93Q8N1F7 819 aa17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms