RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000379615.3

PGGT1B-202, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 903 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-202ENST00000379615 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.3■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 MTMR3Q13615 1198 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 NCAPHQ15003 741 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TEAD2Q15562 447 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPN21Q16825 1174 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP17Q68EM7 881 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 GAREM2Q75VX8 874 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGEF19Q8IW93 802 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 NUP93Q8N1F7 819 aa16.3■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 SLITRK1Q96PX8 696 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 VPS16Q9H269 839 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TASP1Q9H6P5 420 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNK12Q9HB15 430 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 IL21Q9HBE4 155 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa16.3■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 HESX1Q9UBX0 185 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 SORCS3Q9UPU3 1222 aa16.3■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 F11P03951 625 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 KRT5P13647 590 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 GJA1P17302 382 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 NPR3P17342 541 aa16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 RFX1P22670 979 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 YWHAQP27348 245 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 COPB1P53618 953 aaKnown RBP16.29■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 STILQ15468 1287 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 GPR158Q5T848 1215 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 UBALD2Q8IYN6 164 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 SMARCD2Q92925 531 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 KAT5Q92993 513 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 KCNK16Q96T55 309 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TTLL2Q9BWV7 592 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 DUSP16Q9BY84 665 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 FBXO44Q9H4M3 255 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ZFP14Q9HCL3 533 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 MUTYHQ9UIF7 546 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 CNTN6Q9UQ52 1028 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 MYH10P35580 1976 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PTPRDP23468 1912 aa16.29■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 MOSPD3O75425 235 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PDE6CP51160 858 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 CACNA2D1P54289 1103 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 MAP3K7CLP57077 242 aa16.28■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 FILIP1LQ4L180 1135 aa16.28■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP16.28■□□□□ 0.2
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PGGT1B-202ENST00000379615 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa16.28■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 LGALS16A8MUM7 142 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ECI2O75521 394 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ASGR2P07307 311 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PFKLP17858 780 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 WEE1P30291 646 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 AVPR1AP37288 418 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 USP8P40818 1118 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC5A3P53794 718 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 CNGA2Q16280 664 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ARHGAP44Q17R89 818 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 FAM78AQ5JUQ0 283 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 CLEC20AQ6ZU45 233 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 MON1AQ86VX9 555 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 SLC44A3Q8N4M1 653 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 STKLD1Q8NE28 680 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 OVCA2Q8WZ82 227 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ELSPBP1Q96BH3 223 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 ASB16Q96NS5 453 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TRPV4Q9HBA0 871 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 PLCB1Q9NQ66 1216 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 TMEM30AQ9NV96 361 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 NUMBLQ9Y6R0 609 aa16.27■□□□□ 0.2
PGGT1B-202ENST00000379615 DPYSL4O14531 572 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TNFRSF10BO14763 440 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 MED7O43513 233 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 ZNF132P52740 706 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 BCAT1P54687 386 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 BPIFB4P59827 614 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 CYP4F8P98187 520 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 UBXN1Q04323 297 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 TAF10Q12962 218 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 IQCB1Q15051 598 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 GJB7Q6PEY0 223 aa16.26■□□□□ 0.19
PGGT1B-202ENST00000379615 PARM1Q6UWI2 310 aa16.26■□□□□ 0.19
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