RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373779.7

PTPRU-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 5,579 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-202ENST00000373779 C16orf87Q6PH81 154 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 MYOZ2Q9NPC6 264 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ACTL7BQ9Y614 415 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 GAS2O43903 313 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ATXN3P54252 364 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ARPP19P56211 112 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 DDIASQ8IXT1 998 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 INPP5DQ92835 1189 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 HSD17B4P51659 736 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 RNF43Q68DV7 783 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 EXOC3L1Q86VI1 746 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ALG3Q92685 438 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 AURKCQ9UQB9 309 aa18.1■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 DNAJC6O75061 913 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 VDRP11473 427 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 KCNJ2P63252 427 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 DDR1Q08345 913 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 GRAMD4Q6IC98 578 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 GALNT4Q8N4A0 578 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 APOPT1Q96IL0 206 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 LMO7Q8WWI1 1683 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 MAGEB2O15479 319 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ATP9AO75110 1047 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ELK3P41970 407 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 PPATQ06203 517 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 PTPRN2Q92932 1015 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 SAR1AQ9NR31 198 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 CHKAP35790 457 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 RAP1GAPP47736 663 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 WDR18Q9BV38 432 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 DGKIO75912 1065 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 VCAM1P19320 739 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 FLOT2Q14254 428 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 MPZL3Q6UWV2 235 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 APBB2Q92870 758 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 CNPY3Q9BT09 278 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 UNC5CO95185 931 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ZCCHC18P0CG32 403 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 TSPY1Q01534 308 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 TRMT5Q32P41 509 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ABI1Q8IZP0 508 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ELMO2Q96JJ3 720 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 DTNAQ9Y4J8 743 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ADRB2P07550 413 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 PAX7P23759 505 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 NUDT2P50583 147 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 FMO1Q01740 532 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 INPP5AQ14642 412 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 NCLNQ969V3 563 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ZBTB10Q96DT7 871 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 BCL9LQ86UU0 1499 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 HBP1O60381 514 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 SLC34A1Q06495 639 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 BMPR2Q13873 1038 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 IZUMO2Q6UXV1 221 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 FRA10AC1Q70Z53 315 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 ERVK-5Q9HDB9 667 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRU-202ENST00000373779 FCHO1O14526 889 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 ADRA1DP25100 572 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 CNTFP26441 200 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 ZCWPW2Q504Y3 356 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 EFHC1Q5JVL4 640 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 SNX30Q5VWJ9 437 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 CCNJLQ8IV13 435 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 SLC10A4Q96EP9 437 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 NEUROG2Q9H2A3 272 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 GNAT1P11488 350 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 ALADP13716 330 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 SERPINB3P29508 390 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 DCAF6Q58WW2 860 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 USP33Q8TEY7 942 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 SP110Q9HB58 689 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 GJB6O95452 261 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 TMPRSS6Q8IU80 811 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 LRRC57Q8N9N7 239 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 ANGPT2O15123 496 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 E2F6O75461 281 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 PTGER2P43116 358 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 OCA2Q04671 838 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 KDELC2Q7Z4H8 507 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 AGBL3Q8NEM8 1001 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRU-202ENST00000373779 FAM172AQ8WUF8 416 aa18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.7 ms