RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361439.8

NSMCE1-201, Transcript of NSE1 homolog, SMC5-SMC6 complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NSMCE1, Length 1,067 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE1-201ENST00000361439 BRD2P25440 801 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 KRT9P35527 623 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PLA2G4AP47712 749 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PPP3CCP48454 512 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 MAP3K7CLP57077 242 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TAF12Q16514 161 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 DDR2Q16832 855 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SFMBT2Q5VUG0 894 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TMC5Q6UXY8 1006 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SLC47A2Q86VL8 602 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 DRC7Q8IY82 874 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 NUP93Q8N1F7 819 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 EPS8L1Q8TE68 723 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 KCTD13Q8WZ19 329 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 OVCA2Q8WZ82 227 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 HSFY1Q96LI6 401 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SMOQ99835 787 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 ZSWIM1Q9BR11 485 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TTLL2Q9BWV7 592 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 FBXO44Q9H4M3 255 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CYLDQ9NQC7 956 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 ASAH2Q9NR71 780 aa14.62□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PTPRDP23468 1912 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 FAM92AA1XBS5 289 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 LRRC53A6NM62 1247 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TNFRSF10BO14763 440 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 LSM8O95777 96 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PRKCIP41743 596 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SNX16P57768 344 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CDR2Q01850 454 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 ARID5BQ14865 1188 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 RAB41Q5JT25 222 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TRIM72Q6ZMU5 477 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TTC30AQ86WT1 665 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CNGA4Q8IV77 575 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 ZMIZ2Q8NF64 920 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SLC35F5Q8WV83 523 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 NOX5Q96PH1 765 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 KCNK16Q96T55 309 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TMEM30AQ9NV96 361 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 THEGQ9P2T0 379 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 NOCTQ9UK39 431 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CEP83Q9Y592 693 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 REV3LO60673 3130 aa14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SLC38A8A6NNN8 435 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 HHLA1C9JL84 531 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 H3BQ06 376 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 M0QYV0 167 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 MBTPS2O43462 519 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SOAT2O75908 522 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 BEST1O76090 585 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 RHOP08100 348 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PNMA6AP0CW24 399 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CDC25BP30305 580 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CDC25CP30307 473 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CASP14P31944 242 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CDH5P33151 784 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 GPD2P43304 727 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 ACADSBP45954 432 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 RPL34P49207 117 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SLC5A3P53794 718 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CACNA2D1P54289 1103 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PTPN21Q16825 1174 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 SCML4Q8N228 414 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PDZD8Q8NEN9 1154 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 DNAJC7Q99615 494 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 LRRC3Q9BY71 257 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 NCANO14594 1321 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CLUHO75153 1309 aa14.6□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PFKLP17858 780 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 YWHAQP27348 245 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 GPR15P49685 360 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 KIF11P52732 1056 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PDE4CQ08493 712 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 TBX2Q13207 712 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 ASIC2Q16515 512 aa14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 GRASPQ7Z6J2 395 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
NSMCE1-201ENST00000361439 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.6 ms