RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000344528.8

SH3BP4-201, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,044 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-201ENST00000344528 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 C2CD6Q53TS8 623 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 MRNIPQ6NTE8 343 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ARL8AQ96BM9 186 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 CD274Q9NZQ7 290 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM120BA0PK00 339 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ANKRD65E5RJM6 399 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 HIC1Q14526 733 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TTLL9Q3SXZ7 439 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ANO5Q75V66 913 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC47A2Q86VL8 602 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 OR2W6PQ8NHA6 318 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SYT15Q9BQS2 421 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 DPP7Q9UHL4 492 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 AP4E1Q9UPM8 1137 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ARHGAP10A1A4S6 786 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 CHRM3P20309 590 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 TM4SF1P30408 202 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 SARSP49591 514 aaKnown RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 KCNT1Q5JUK3 1230 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 COG4Q9H9E3 785 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 PKD2L2Q9NZM6 624 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 USP18Q9UMW8 372 aa16.96■□□□□ 0.31
SH3BP4-201ENST00000344528 C2orf81A6NN90 581 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 NPM3O75607 178 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ASS1P00966 412 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 IL10P22301 178 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 SPDYAQ5MJ70 313 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRC8EQ6NSJ5 796 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ADCK2Q7Z695 626 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ZIM3Q96PE6 472 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 FUCA2Q9BTY2 467 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 RUBCNLQ9H714 662 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 RRN3Q9NYV6 651 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ADGRB2O60241 1585 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 TGM2P21980 687 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 OVOS1Q6IE37 1185 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 CATSPERGQ6ZRH7 1159 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 VSIG10LQ86VR7 867 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM131BQ86XD5 332 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP4K3Q8IVH8 894 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 RXFP2Q8WXD0 754 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 SERPINB12Q96P63 405 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC7A5P2Q9GIP4 190 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ANLNQ9NQW6 1124 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 TBC1D12O60347 775 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 APOA4P06727 396 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 RAP1GAPP47736 663 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 MAP3K7CLP57077 242 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 MTM1Q13496 603 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 FAM83EQ2M2I3 478 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 MDH1BQ5I0G3 518 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 C6orf10Q5SRN2 563 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 PACSIN1Q9BY11 444 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 PABPC3Q9H361 631 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC39A10Q9ULF5 831 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 CDY2AQ9Y6F7 541 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 CDY1Q9Y6F8 540 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 SUPT3HB4E1H0 165 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 KDM1AO60341 852 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 RHOBTB1O94844 696 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 PSEN2P49810 448 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 RRM2BQ7LG56 351 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ACTRT1Q8TDG2 376 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC35C1Q96A29 364 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 PGM1P36871 562 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 AARS2Q5JTZ9 985 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 SLC20A1Q8WUM9 679 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 CCT8L2Q96SF2 557 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 KIF1AQ12756 1690 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 CASTOR2A6NHX0 329 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 EML1O00423 815 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 PEX19P40855 299 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 EPHB3P54753 998 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 C11orf63Q6NUN7 778 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 VCPIP1Q96JH7 1222 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 LACRTQ9GZZ8 138 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 NPHS2Q9NP85 383 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 TKTL1P51854 596 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 ST3GAL1Q11201 340 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 DNAL1Q4LDG9 190 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 TMEM259Q4ZIN3 620 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 CERS5Q8N5B7 392 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP4-201ENST00000344528 MTMR9Q96QG7 549 aa16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms