RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP9BO43861 1147 aa21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 LGR5O75473 907 aa21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM63AO94886 807 aa21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 RPL22P35268 128 aaKnown RBP21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 BST1Q10588 318 aa21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 EFHC1Q5JVL4 640 aa21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SH2D4BQ5SQS7 431 aa21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 E2F7Q96AV8 911 aa21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 IDI2Q9BXS1 227 aa21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 KLHL4Q9C0H6 718 aa21.14■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 DHX15O43143 795 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SPAG6O75602 509 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 HLA-DRAP01903 254 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 KBTBD12Q3ZCT8 623 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP3K21Q5TCX8 1036 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM270Q6UE05 265 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 KLHL23Q8NBE8 558 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF516Q92618 1163 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM213AQ9BRX8 229 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ZC3H12CQ9C0D7 883 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 BTAF1O14981 1849 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM150BA6NC51 233 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 F8VP50 259 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SERPINA6P08185 405 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MMP8P22894 467 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CUL2Q13617 745 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ACTL9Q8TC94 416 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MCEEQ96PE7 176 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SORCS3Q9UPU3 1222 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 EFR3BQ9Y2G0 817 aa21.13■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TCRBV7S3A2A0A539 114 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CALB1P05937 261 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 GARTP22102 1010 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ALDH18A1P54886 795 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 AQP5P55064 265 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ITGA9Q13797 1035 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PIGHQ14442 188 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 DNAJC24Q6P3W2 148 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PTF1AQ7RTS3 328 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CRLF3Q8IUI8 442 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 C4orf19Q8IY42 314 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 GSTCDQ8NEC7 633 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 A0A088AWK7 358 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ASLP04424 464 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ELK3P41970 407 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 GRIA2P42262 883 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP8P85298 464 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ZACNQ401N2 412 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SFT2D3Q587I9 215 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 DCUN1D2Q6PH85 259 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 NIPA1Q7RTP0 329 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SPIRE2Q8WWL2 714 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM84AQ96KN4 292 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa21.12■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 A6NJR5 290 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 FAM155BO75949 473 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATA31D3P0C874 917 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 RGS2P41220 211 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 DYNLT1P63172 113 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MTM1Q13496 603 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MYBPC3Q14896 1274 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 XKR9Q5GH70 373 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SPOPLQ6IQ16 392 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 JADE3Q92613 823 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 RILPQ96NA2 401 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 MECRQ9BV79 373 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PLLPQ9Y342 182 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 KBTBD13C9JR72 458 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 AOC1P19801 751 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CPOXP36551 454 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TAP1Q03518 808 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CHI3L2Q15782 390 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC26A11Q86WA9 606 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SP8Q8IXZ3 490 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PREBQ9HCU5 417 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 GALNT8Q9NY28 637 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PTTG2Q9NZH5 202 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 SIRPGQ9P1W8 387 aa21.11■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP42A6NI28 874 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 TMCC1O94876 653 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 VCLP18206 1134 aa21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 YWHAGP61981 247 aaKnown RBP eCLIP21.1■□□□□ 0.97
PPP1CC-201ENST00000335007 CLDN10P78369 228 aa21.1■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.7 ms