RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000332029.2

SOCS1-201, Transcript of suppressor of cytokine signaling 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOCS1, Length 1,225 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOCS1-201ENST00000332029 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CAMKK1Q8N5S9 505 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 FSIP1Q8NA03 581 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ATP2A3Q93084 1043 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 HHIPQ96QV1 700 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CGRRF1Q99675 332 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 SYT15Q9BQS2 421 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CGNQ9P2M7 1197 aaKnown RBP22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 SERTAD1Q9UHV2 236 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 WNT6Q9Y6F9 365 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 DENND4CQ5VZ89 1909 aa22.55■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 OBSL1O75147 1896 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ATP2C2O75185 946 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 AKAP3O75969 853 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 SLFN14P0C7P3 912 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 LMO2P25791 158 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 MAGEA11P43364 429 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 C12orf56Q8IXR9 622 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 MMS19Q96T76 1030 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 GCNT4Q9P109 453 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CDH9Q9ULB4 789 aa22.54■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 C2orf78A6NCI8 922 aa22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CST3P01034 146 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF806P0C7X5 589 aa22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 WARSP23381 471 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 KCNB1Q14721 858 aa22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 EML3Q32P44 896 aa22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 IL31Q6EBC2 164 aa22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 SH3RF2Q8TEC5 729 aa22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CD101Q93033 1021 aa22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 MYLPFQ96A32 169 aa22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 PAGE5Q96GU1 130 aa22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CACNA1BQ00975 2339 aa22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 PDGFRBP09619 1106 aa22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 KCNA4P22459 653 aa22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 LIMK1P53667 647 aa22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 VSTM1Q6UX27 236 aa22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 SYT13Q7L8C5 426 aa22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 GOLGA5Q8TBA6 731 aa22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 SPATA17Q96L03 361 aa22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 CRTAC1Q9NQ79 661 aa22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa22.52■■□□□ 1.2
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 KLRC4O43908 158 aa22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 EXOC3O60645 756 aa22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 TCF3P15923 654 aa22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 HDCP19113 662 aa22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 BDNFP23560 247 aa22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 CMA1P23946 247 aa22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 NR1H3Q13133 447 aa22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 ZNF516Q92618 1163 aa22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 ACDQ96AP0 544 aa22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 PCDHGA5Q9Y5G8 931 aa22.51■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 SDK1Q7Z5N4 2213 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 A0A1B0GVL5 298 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 TACC1O75410 805 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 APBB3O95704 486 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 FAM163BP0C2L3 166 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 PFKFB1P16118 471 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 GRIK1P39086 918 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 PDE6CP51160 858 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 STK4Q13043 487 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 PSMD2Q13200 908 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 TRPC3Q13507 836 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 DMC1Q14565 340 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 WDR72Q3MJ13 1102 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 PLA2G2CQ5R387 149 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 LINC00597Q9H2U6 94 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 SNX25Q9H3E2 840 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 RXFP3Q9NSD7 469 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 EXOC1Q9NV70 894 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 USP25Q9UHP3 1055 aa22.5■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 NFATC1O95644 943 aa22.49■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 ANXA13P27216 316 aa22.49■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 MPLP40238 635 aa22.49■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 USP46P62068 366 aa22.49■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 TNNC1P63316 161 aa22.49■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 CYP27A1Q02318 531 aa22.49■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 PLK5Q496M5 336 aa22.49■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 KMT5BQ4FZB7 885 aa22.49■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.49■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 KIAA0895Q8NCT3 520 aa22.49■■□□□ 1.19
SOCS1-201ENST00000332029 OR6B3Q8NGW1 331 aa22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.4 ms