RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000312233.4

GLIS1-201, Transcript of GLIS family zinc finger 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 2 BASIC

Gene GLIS1, Length 2,812 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLIS1-201ENST00000312233 HADHBP55084 474 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 SIGIRRQ6IA17 410 aa18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 LCORLQ8N3X6 602 aa18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 TAMM41Q96BW9 452 aa18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 ISOC1Q96CN7 298 aa18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC124Q96CT7 223 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC106Q9BWC9 280 aa18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 SCINQ9Y6U3 715 aa18.21■□□□□ 0.51
GLIS1-201ENST00000312233 TJP1Q07157 1748 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 E5RJQ4 531 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 PSMD12O00232 456 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 COASYQ13057 564 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 RHOT2Q8IXI1 618 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC138Q96M89 665 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 SYT11Q9BT88 431 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CDH19Q9H159 772 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 ACP6Q9NPH0 428 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CHST7Q9NS84 486 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 IFT52Q9Y366 437 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 KMOO15229 486 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 SPOPO43791 374 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 ARHGAP8P85298 464 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CTBSQ01459 385 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 PTK7Q13308 1070 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 EPHA7Q15375 998 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 RALGPS1Q5JS13 557 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 KBTBD6Q86V97 674 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 PQLC1Q8N2U9 271 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 HPS1Q92902 700 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 SLC2A11Q9BYW1 496 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 PALMDQ9NP74 551 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 ERGIC3Q9Y282 383 aa18.2■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CLDN3O15551 220 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 FARP2O94887 1054 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CDKL1Q00532 357 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 PGM2L1Q6PCE3 622 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 GRAMD2AQ8IUY3 354 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 RTKN2Q8IZC4 609 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 ATG4AQ8WYN0 398 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CD101Q93033 1021 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 OLFM1Q99784 485 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 J3QRK9 145 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 FXNQ16595 210 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 FAM26FQ5R3K3 315 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CENPUQ71F23 418 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 TTC30AQ86WT1 665 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 MMAAQ8IVH4 418 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 LILRB4Q8NHJ6 448 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 GRIN3AQ8TCU5 1115 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 ATP2A3Q93084 1043 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 FBXL8Q96CD0 374 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 WNT8AQ9H1J5 351 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 KCNK4Q9NYG8 393 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 POMPQ9Y244 141 aa18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP18.19■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 TM9SF1O15321 606 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CCDC130P13994 396 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 PEX3P56589 373 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 MESDQ14696 234 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CPNE8Q86YQ8 564 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 ESX1Q8N693 406 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 GOLM1Q8NBJ4 401 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 VPS45Q9NRW7 570 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 C6orf203Q9P0P8 240 aaPredicted RBP18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 A6NL46 340 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 KRT75O95678 551 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 HOXD10P28358 340 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 BMXP51813 675 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 NDST2P52849 883 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 CADM3Q8N126 398 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 KCTD10Q9H3F6 313 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 ALOX15BO15296 676 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 PARNO95453 639 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 SCNN1DP51172 638 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 TUBA1BP68363 451 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 TTC23LQ6PF05 361 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 TUBA1AQ71U36 451 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 PDZD8Q8NEN9 1154 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 RAD54LQ92698 747 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 SAYSD1Q9NPB0 183 aa18.18■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 A8MU76 341 aa18.17■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 BGNP21810 368 aa18.17■□□□□ 0.5
GLIS1-201ENST00000312233 SOX5P35711 763 aa18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.3 ms