RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299314.11

GNPTAB-201, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 5,701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 USP31Q70CQ4 1352 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 HEATR9A2RTY3 570 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 LUZP2Q86TE4 346 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ANKZF1Q9H8Y5 726 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM153AQ9UHL3 310 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 MAFGO15525 162 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 KATNAL1Q9BW62 490 aa25.03■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 FIGNQ5HY92 759 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CCNJLQ8IV13 435 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 WWOXQ9NZC7 414 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNQ2O43526 872 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 PMPCBO75439 489 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 NPTXRO95502 500 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 GEMP55040 296 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 DCP1BQ8IZD4 617 aaKnown RBP25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ZBTB10Q96DT7 871 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 STK25O00506 426 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 RASA2Q15283 850 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 RNF112Q9ULX5 631 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 SDR42E2A6NKP2 422 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP2C8P10632 490 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CYP11B1P15538 503 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 EPHB2P29323 1055 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 CACHD1Q5VU97 1274 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 UGT3A1Q6NUS8 523 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf74Q86VG3 221 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 HS6ST3Q8IZP7 471 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 IMPAD1Q9NX62 359 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 HPSEQ9Y251 543 aa25.02■■□□□ 1.6
GNPTAB-201ENST00000299314 GUCA1CO95843 209 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 FAM200BP0CF97 657 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RIN3Q8TB24 985 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 UBOX5O94941 541 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 HPCAP84074 193 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 C2CD6Q53TS8 623 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 KCNT1Q5JUK3 1230 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 C11orf63Q6NUN7 778 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TTI2Q6NXR4 508 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CCDC126Q96EE4 140 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RXFP1Q9HBX9 757 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MED24O75448 989 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 PTPN4P29074 926 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 STKLD1Q8NE28 680 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SOX13Q9UN79 622 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 M0QYT0 321 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 IZUMO2Q6UXV1 221 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ZNF333Q96JL9 665 aa25.01■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CFAP99D6REC4 459 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CHSY1Q86X52 802 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 C17orf75Q9HAS0 396 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 BGNP21810 368 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MUTP22033 750 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SEL1L3Q68CR1 1132 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 YAF2Q8IY57 180 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 GLMNQ92990 594 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 DPP3Q9NY33 737 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TIMM44O43615 452 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RPS6KA5O75582 802 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 PDK2Q15119 407 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 RDM1Q8NG50 284 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 FBXO25Q8TCJ0 367 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 IARS2Q9NSE4 1012 aaKnown RBP25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MGAT5BQ3V5L5 792 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TERB1Q8NA31 727 aa25■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 CASP4P49662 377 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 PLIN5Q00G26 463 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 OASLQ15646 514 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NME5P56597 212 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 GALNTL6Q49A17 601 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 PDPK2PQ6A1A2 396 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 SPATA16Q9BXB7 569 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 UBE2Q2LH0YL09 131 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 TM9SF1O15321 606 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 ORC1Q13415 861 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 NUDT18Q6ZVK8 323 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 OTOAQ7RTW8 1153 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 WDCPQ9H6R7 721 aa24.99■■□□□ 1.59
GNPTAB-201ENST00000299314 MAP3K6O95382 1288 aa24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms