RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000286353.8

PXYLP1-201, Transcript of 2-phosphoxylose phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PXYLP1, Length 3,281 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXYLP1-201ENST00000286353 USP3Q9Y6I4 520 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 M0QYV0 167 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 TGM2P21980 687 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 CHKAP35790 457 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 SLC6A3Q01959 620 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 SREBF2Q12772 1141 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 SLC29A2Q14542 456 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 NOMO1Q15155 1222 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 CCDC14Q49A88 953 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 ERMARDQ5T6L9 678 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 SH2D3CQ8N5H7 860 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 CPA4Q9UI42 421 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 CLEC11AQ9Y240 323 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 ADAMTS4O75173 837 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 IL4RP24394 825 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 OSTNP61366 133 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 DCUN1D2Q6PH85 259 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 FAM228AQ86W67 206 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 NAT8LQ8N9F0 302 aa15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 NXF3Q9H4D5 531 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 SSU72Q9NP77 194 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 MIPP30301 263 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 ACADSBP45954 432 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 BST2Q10589 180 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 PPP1R7Q15435 360 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 DPYSL2Q16555 572 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 SV2CQ496J9 727 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 FBXO47Q5MNV8 452 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 NINJ2Q9NZG7 142 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 USP18Q9UMW8 372 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 BCAT1P54687 386 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 DPYSL3Q14195 570 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 DSC3Q14574 896 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 OR2W6PQ8NHA6 318 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 IPPQ9Y573 584 aa15.96■□□□□ 0.15
PXYLP1-201ENST00000286353 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 PTGESO14684 152 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 PPEF2O14830 753 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 ALOX15BO15296 676 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 TREHO43280 583 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 FAM107AO95990 144 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 CCL14Q16627 93 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 UBAP2Q5T6F2 1119 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 C4orf22Q6V702 233 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 CATSPER4Q7RTX7 472 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 GSTCDQ8NEC7 633 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 C9IYK1 514 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 ZNF623O75123 536 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 KRT19P08727 400 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 GCAP28676 217 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 RAB41Q5JT25 222 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 TMEM130Q8N3G9 435 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 OSMRQ99650 979 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 TPX2Q9ULW0 747 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 TRPV2Q9Y5S1 764 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 COL4A6Q14031 1691 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 SPTLC1O15269 473 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 CA12O43570 354 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 HUNKP57058 714 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 GNGT1P63211 74 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 XRCC4Q13426 336 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 BOLA3Q53S33 107 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 PMF1Q6P1K2 205 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 C6orf89Q6UWU4 347 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 STRADAQ7RTN6 431 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 ZNF317Q96PQ6 595 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 SLC2A13Q96QE2 648 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa15.95■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 E5RJQ4 531 aa15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 FGFR1P11362 822 aa15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 AIF1P55008 147 aa15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 PLCB3Q01970 1234 aa15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 STAT4Q14765 748 aa15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 BEND5Q7L4P6 421 aa15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 KPNA7A9QM74 516 aa15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 PAPSS1O43252 624 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 ZNF394Q53GI3 561 aa15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 IZUMO3Q5VZ72 239 aa15.94■□□□□ 0.14
PXYLP1-201ENST00000286353 DNAI2Q9GZS0 605 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms