RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000266058.8

SLIT1-201, Transcript of slit guidance ligand 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SLIT1, Length 7,925 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIT1-201ENST00000266058 MANSC1Q9H8J5 431 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 RNF181Q9P0P0 153 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 ZBTB7AO95365 584 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 ATP6V1B1P15313 513 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 TRIM16LQ309B1 348 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 JAMLQ86YT9 394 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 PI4K2AQ9BTU6 479 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 KLHL1Q9NR64 748 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 ZDHHC9Q9Y397 364 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 CYP4A22Q5TCH4 519 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 NEDD1Q8NHV4 660 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 TALDO1P37837 337 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 PRIM2P49643 509 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 ZSCAN2Q7Z7L9 614 aaPredicted RBP14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 RAB23Q9ULC3 237 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 SLC39A10Q9ULF5 831 aa14.71□□□□□ -0.05
SLIT1-201ENST00000266058 PRODHO43272 600 aa14.71□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 DGAT1O75907 488 aa14.71□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 SNRPAP09012 282 aaKnown RBP14.71□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CHRM3P20309 590 aa14.71□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 AKAP5P24588 427 aa14.71□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 PTPN7P35236 360 aa14.71□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 FAM71DQ8N9W8 422 aa14.71□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 GAL3ST3Q96A11 431 aa14.71□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 POU1F1P28069 291 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CEBPGP53567 150 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 NAB2Q15742 525 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ACSF2Q96CM8 615 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ING3Q9NXR8 418 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 PAK5Q9P286 719 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 VAV3Q9UKW4 847 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 HPS5Q9UPZ3 1129 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 NINQ8N4C6 2090 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ALOX15P16050 662 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 PLCL1Q15111 1095 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 KCNV1Q6PIU1 500 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 STOX1Q6ZVD7 989 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 GOLPH3Q9H4A6 298 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ELP3Q9H9T3 547 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 SMAPO00193 183 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 RGS4P49798 205 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 AGBL2Q5U5Z8 902 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ZIM3Q96PE6 472 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 C7orf25Q9BPX7 421 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CFAP99D6REC4 459 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 AVPR1AP37288 418 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 EPC2Q52LR7 807 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 MICALL2Q8IY33 904 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 MYMKA6NI61 221 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CCZ1BP86790 482 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 OTOAQ7RTW8 1153 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CLEC10AQ8IUN9 316 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ADSSL1Q8N142 457 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 KIF2CQ99661 725 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 SMCO3A2RU48 225 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CST8O60676 142 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 PGM3O95394 542 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 MGAT5BQ3V5L5 792 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 XKR3Q5GH77 459 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TIPINQ9BVW5 301 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CYLDQ9NQC7 956 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 LAMC1P11047 1609 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 ALDH1A3P47895 512 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 NR1I3Q14994 352 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 LRRC39Q96DD0 335 aa14.7□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 PRR36Q9H6K5 1346 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 GUCY1B2O75343 617 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 CCND1P24385 295 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 TARSP26639 723 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 GPC1P35052 558 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 NDUFAF6Q330K2 333 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 GPAT2Q6NUI2 795 aa14.69□□□□□ -0.06
SLIT1-201ENST00000266058 EPHX4Q8IUS5 362 aa14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms