RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258424.2

COX5B-201, Transcript of cytochrome c oxidase subunit 5B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene COX5B, Length 712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX5B-201ENST00000258424 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP22.33■■□□□ 1.17
COX5B-201ENST00000258424 PES1O00541 588 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TRIM66O15016 1216 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 AP1G2O75843 785 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 BEST1O76090 585 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ASGR2P07307 311 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ATP1A3P13637 1013 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 PTPN5P54829 565 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 USP46P62068 366 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 KCNMA1Q12791 1236 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 IQCB1Q15051 598 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TEAD2Q15562 447 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TAF12Q16514 161 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TMEM270Q6UE05 265 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TMEM150AQ86TG1 271 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 MCRS1Q96EZ8 462 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CYFIP2Q96F07 1278 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 HEXIM2Q96MH2 286 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 MYO16Q9Y6X6 1858 aa22.32■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TADA3O75528 432 aa22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 MICAL2O94851 1124 aa22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ANXA13P27216 316 aa22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 COPB1P53618 953 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 VCPP55072 806 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CYP4F8P98187 520 aa22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 STXBP5Q5T5C0 1151 aa22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 APEX2Q9UBZ4 518 aa22.31■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CALCAP01258 141 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 F11P03951 625 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ARHGAP17Q68EM7 881 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CLEC20AQ6ZU45 233 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 RSAD2Q8WXG1 361 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 MYRFLQ96LU7 910 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CEP295NLQ96MC4 621 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ZSWIM3Q96MP5 696 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ATXN3LQ9H3M9 355 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CBX8Q9HC52 389 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 SMTNL1A8MU46 457 aa22.29■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 FAM200BP0CF97 657 aa22.29■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CDC25CP30307 473 aa22.29■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ZNF132P52740 706 aa22.29■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 HTR4Q13639 388 aa22.29■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TTLL2Q9BWV7 592 aa22.29■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 DNAI2Q9GZS0 605 aa22.29■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 GDE1Q9NZC3 331 aa22.29■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CNTN6Q9UQ52 1028 aa22.29■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ANHXE9PGG2 379 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TNFRSF10BO14763 440 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 FGF19O95750 216 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CD19P15391 556 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 MFAP3P55082 362 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 MAP3K7CLP57077 242 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TCF15Q12870 199 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 PARM1Q6UWI2 310 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TFAP2BQ92481 460 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 FGF14Q92915 247 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ZSWIM1Q9BR11 485 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 LSM14BQ9BX40 385 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 SMOC2Q9H3U7 446 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 KCNK12Q9HB15 430 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 NUMBLQ9Y6R0 609 aa22.28■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 LGALS16A8MUM7 142 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 BECN2A8MW95 431 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 HHLA1C9JL84 531 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 PAEPP09466 180 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 FCARP24071 287 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 KLK7P49862 253 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ARHGAP44Q17R89 818 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 SGO2Q562F6 1265 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 FAM78AQ5JUQ0 283 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 LUZP1Q86V48 1076 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 TTC30AQ86WT1 665 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 NUP93Q8N1F7 819 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 JAKMIP2Q96AA8 810 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 GCNAQ96QF7 691 aa22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 RPP25Q9BUL9 199 aaKnown RBP22.27■■□□□ 1.16
COX5B-201ENST00000258424 DUSP16Q9BY84 665 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.7 ms