RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000223864.6

PLGRKT-201, Transcript of plasminogen receptor with a C-terminal lysine, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLGRKT, Length 932 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLGRKT-201ENST00000223864 CYP4F8P98187 520 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ENPEPQ07075 957 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ADAM9Q13443 819 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 EDRF1Q3B7T1 1238 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 C1orf220Q5T0J3 134 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SDHAF4Q5VUM1 108 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 VSTM1Q6UX27 236 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SV2AQ7L0J3 742 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 TMEM150AQ86TG1 271 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SCN4BQ8IWT1 228 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 PATJQ8NI35 1801 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATA20Q8TB22 786 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 MYLPFQ96A32 169 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 RSPRY1Q96DX4 576 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 PCED1BQ96HM7 432 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 FOXQ1Q9C009 403 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 OBP2AQ9NY56 170 aa18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 F5P12259 2224 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC38A8A6NNN8 435 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF263O14978 683 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 PTPN1P18031 435 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 CYP27A1Q02318 531 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 FCHO2Q0JRZ9 810 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 TPRG1Q6ZUI0 275 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 YAF2Q8IY57 180 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM186BQ8IYM0 893 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SMYD4Q8IYR2 804 aaPredicted RBP18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 STKLD1Q8NE28 680 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 TAF4BQ92750 862 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 CEP295NLQ96MC4 621 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 NELL2Q99435 816 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SLC46A2Q9BY10 475 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 OSBPL6Q9BZF3 934 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 HEBP1Q9NRV9 189 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 CACNA1IQ9P0X4 2223 aa18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 HELZP42694 1942 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 A8MXQ7 604 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 DCNP07585 359 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 KRT13P13646 458 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 BDNFP23560 247 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 PRCPP42785 496 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 MCCD1P59942 119 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 COBLL1Q53SF7 1204 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 MDH1BQ5I0G3 518 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 CMTM8Q8IZV2 173 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SMARCE1Q969G3 411 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SPATA17Q96L03 361 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 SMYD3Q9H7B4 428 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 LTB4R2Q9NPC1 389 aa18.34■□□□□ 0.53
PLGRKT-201ENST00000223864 FAM170BA6NMN3 283 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 CHADO15335 359 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 CLSTN1O94985 981 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 PRAMEF12O95522 483 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 ASS1P00966 412 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 P4HA1P13674 534 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 CD72P21854 359 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 GRIK1P39086 918 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 CDH8P55286 799 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 UBXN2BQ14CS0 331 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 ZNF852Q6ZMS4 543 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 MON1AQ86VX9 555 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 MAB21L3Q8N8X9 362 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 B3GALNT2Q8NCR0 500 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRC3BQ96PB8 259 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 DPEP3Q9H4B8 488 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 FANCMQ8IYD8 2048 aa18.33■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 SHISA7A6NL88 538 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 ARNTLO00327 626 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 MAN2B1O00754 1011 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 CETN3O15182 167 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 LRRN2O75325 713 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 HLA-DRAP01903 254 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 GLULP15104 373 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 ANXA13P27216 316 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 AVPR1AP37288 418 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 PIK3CAP42336 1068 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 PPP3CAQ08209 521 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 ANGPT1Q15389 498 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 BPIFB1Q8TDL5 484 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 ELMO3Q96BJ8 720 aa18.32■□□□□ 0.52
PLGRKT-201ENST00000223864 C8orf48Q96LL4 319 aa18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms