RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000064190.12

Rai1-201, Transcript of Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rai1, Length 7,348 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1-201ENSMUST00000064190 Oas1cQ924S2 362 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mccc1Q99MR8 717 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 DmgdhQ9DBT9 869 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zbed6D2EAC2 980 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cct3P80318 545 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tmem247Q497K7 211 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Kctd19Q562E2 927 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Klra5Q60652 266 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mief1Q8BGV8 463 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tmem145Q8C4U2 746 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Znf24Q91VN1 368 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Golph3Q9CRA5 298 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 NumbQ9QZS3 653 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tbc1d25A1A5B6 742 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cdh19E9Q3A7 770 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 InvsO89019 1062 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cst8P32766 142 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 N6amt1Q6SKR2 214 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Znf579Q80VM4 562 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Slc35g1Q8BY79 368 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Atg7Q9D906 698 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm44G3UW88 330 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vps26aP40336 327 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mif4gdQ3UBZ5 222 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ugt3a1Q3UP75 523 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Spag6Q3V0U9 509 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vps72Q62481 368 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ccdc120A2AEV7 629 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm13941A2AJ38 245 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 6030498E09RikB1AX85 169 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Grem2O88273 168 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tmem120bQ3TA38 339 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Vwa3aQ3UVV9 1148 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Zfp317Q8C0Q5 607 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Dennd2aQ8C4S8 1000 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Adamts2Q8C9W3 1213 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Plekhg6Q8R0J1 787 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 McamQ8R2Y2 648 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 WaslQ91YD9 501 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Homer3Q99JP6 356 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 PpidQ9CR16 370 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Elp3Q9CZX0 547 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pou5f2Q9DAC9 329 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gnat1P20612 350 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Mxi1P50540 228 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Prrg3Q6PAQ9 231 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nlrp4bQ8C6J9 863 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ppp1r3aQ99MR9 1089 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tmem47Q9JJG6 181 aa16.57■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nr3c1P06537 783 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ap2a2P17427 938 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Fbxw10Q5SUS0 1030 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Dnajc11Q5U458 559 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Grid1Q61627 1009 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cep78Q6IRU7 790 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ssxb5Q6XAS2 159 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gcfc2Q8BKT3 769 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Snx17Q8BVL3 470 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cmtr1Q9DBC3 837 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Cdc40Q9DC48 579 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Wdr62Q3U3T8 1523 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Krt28A6BLY7 462 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 F830016B08RikG3UWE2 416 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Hk2O08528 917 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Serpinb6dQ3UWK8 375 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ppp1r14bQ62084 147 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Smarca1Q6PGB8 1046 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pcmtd2Q8BHD8 359 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Camkk2Q8C078 588 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Serpinb9bQ9DAV6 377 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ttll8A4Q9F1 832 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm9992B2RWK3 458 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Shoc2O88520 582 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Sept1P42209 366 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Unc93aQ710D3 458 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tsen15Q8R3W5 168 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Pcdha5Q91Y15 934 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 BniplQ99JU7 328 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Hao1Q9WU19 370 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm10406A6NAS4 205 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm3373A6NAS7 205 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm3298E9PW80 205 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm3667K7N757 205 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 PcnaP17918 261 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Chp1P61022 195 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm3558Q5FWC9 205 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rsbn1Q80T69 795 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ldlrap1Q8C142 308 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Ciapin1Q8WTY4 309 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Nudt12Q9DCN1 462 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Tcea2Q9QVN7 299 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Dyrk1bQ9Z188 629 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Gm5930D3Z257 264 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 SnrpaQ62189 287 aaKnown RBP16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Krt40Q6IFX3 439 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Rmnd5aQ80YQ8 391 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Eps8l1Q8R5F8 716 aa16.56■□□□□ 0.24
Rai1-201ENSMUST00000064190 Hes6Q9JHE6 224 aa16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms