RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000026390.7

Rabgef1-201, Transcript of Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Rabgef1, Length 2,828 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rbp3P49194 1234 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf112Q0VAW7 879 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 9130409I23RikQ3TS87 320 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ifnl2Q4VK74 193 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmc8Q7TN58 722 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Fam49aQ8BHZ0 323 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RbakQ8BQC8 711 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 RalylQ8BTF8 293 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Iffo1Q8BXL9 562 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmx4Q8C0L0 335 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ints9Q8K114 658 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cgref1Q8R1U2 281 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc42Q8R2U7 421 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rin1Q921Q7 763 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mfsd5Q921Y4 450 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc39a3Q99K24 317 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tpgs1Q99MS8 303 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 CactinQ9CS00 772 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 GOLGA7BQ9D428 167 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm3404Q9D506 307 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Atg7Q9D906 698 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc25a19Q9DAM5 318 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kifc1Q9QWT9 674 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Krt16Q9Z2K1 469 aa10.71□□□□□ -0.69
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cyp27b1O35084 507 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Banf1O54962 89 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ppargc1aO70343 797 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 PrlP06879 226 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Hoxb8P09632 243 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 InscQ3HNM7 579 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Papss1Q60967 624 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Txndc8Q69AB2 127 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nlrp14Q6B966 993 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 SnphQ80U23 495 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 MogsQ80UM7 834 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pkn3Q8K045 878 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gle1Q8R322 699 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ugp2Q91ZJ5 508 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TarsQ9D0R2 722 aaKnown RBP10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 1700109H08RikQ9D9C0 210 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Trpm5Q9JJH7 1158 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sfmbt1Q9JMD1 863 aa10.71□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gm44511A0A0N4SW10 223 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gucy2dA0A0U1RPR8 1117 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vmn2r84D3YWE3 849 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gimd1E9PW74 217 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adam19O35674 920 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Itgb3O54890 787 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Abcb1bP06795 1276 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klrb1bP27812 223 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mark3Q03141 753 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ubn1Q4G0F8 1135 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 StilQ60988 1262 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rab34Q64008 259 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Xlr3bQ6P205 226 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kif11Q6P9P6 1052 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Sh3tc2Q80VA5 1289 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Arhgap15Q811M1 481 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Aste1Q8BIR2 672 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Def6Q8C2K1 630 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Kat14Q8CID0 779 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc14Q8VC16 493 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Wdr98Q8VC42 657 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zfp64Q99KE8 643 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Zmynd10Q99ML0 440 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Acbd6Q9D061 282 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Drc3Q9D5E4 523 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Gpatch1Q9DBM1 930 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pold3Q9EQ28 462 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pcsk1nQ9QXV0 258 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Cacna2d3Q9Z1L5 1091 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ttc3O88196 1979 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Siah3B2RWG3 268 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 AlpiF8VPQ6 554 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Farp1F8VPU2 1048 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Nek2O35942 443 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Plk1Q07832 603 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Slc26a2Q62273 739 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Efcab14Q8BGQ6 484 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Stau2Q8CJ67 570 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dnm1lQ8K1M6 742 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Ace2Q8R0I0 805 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Vps37cQ8R105 352 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Itgbl1Q8VDV0 494 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Pomgnt1Q91X88 660 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Adi1Q99JT9 179 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Q99KU6 348 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Mms19Q9D071 1031 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Lrrc71Q9D3W5 558 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Rsph3bQ9DA80 389 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Znf654Q9DAU9 571 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Klc4Q9DBS5 619 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Tmod3Q9JHJ0 352 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Prl2a1Q9JHK0 228 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Orc3Q9JK30 715 aaKnown RBP10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Clcn2Q9R0A1 908 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 St6galnac4Q9R2B6 360 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 TfgQ9Z1A1 397 aa10.7□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Card9A2AIV8 536 aa10.69□□□□□ -0.7
Rabgef1-201ENSMUST00000026390 Dusp8O09112 663 aa10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 18.3 ms