RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TktP40142 623 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cracr2aQ3UP38 310 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kctd16Q5DTY9 427 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bcar1Q61140 874 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Foxn1Q61575 648 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif11Q6P9P6 1052 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aoc2Q812C9 757 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxw21Q8BI38 468 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aste1Q8BIR2 672 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wdr98Q8VC42 657 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr30Q8VGD8 315 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Micu3Q9CTY5 523 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Psma8Q9CWH6 250 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 VasnQ9CZT5 673 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam114a1Q9D281 569 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccdc83Q9D4V3 305 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp236S4R299 1847 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kpna6O35345 536 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AmhP27106 555 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kif5cP28738 956 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd86P42082 309 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PfkmP47857 780 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 St3gal1P54751 337 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gabbr2Q80T41 940 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8CCC3 530 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trib2Q8K4K3 343 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc35f6Q8VE96 372 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tpgs1Q99MS8 303 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tdrd12Q9CWU0 1215 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Acbd6Q9D061 282 aa20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gys1Q9Z1E4 738 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Orc1Q9Z1N2 840 aaKnown RBP20.71■□□□□ 0.91
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kiaa1522A2A7S8 1013 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcdh9F8VPK8 1237 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r1O70410 912 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 AfpP02772 605 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp42P22227 288 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rab20P35295 233 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pcsk1P63239 753 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SPINDOCQ05AH6 381 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tex11Q14AT2 947 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ptcd3Q14C51 685 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Atl2Q6PA06 583 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Anapc5Q8BTZ4 740 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnv1Q8BZN2 503 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Msantd4Q91YU3 345 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 GarsQ9CZD3 729 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 TtpalQ9D3D0 343 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scyl1Q9EQC5 806 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pidd1Q9ERV7 915 aa20.7■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Skint7A7XV04 395 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prpmp5E9PXN1 296 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr731F8VQB9 326 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nek2O35942 443 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aff1O88573 1216 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp2c39P56656 490 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam172aQ3TNH5 417 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HnrnpdQ60668 355 aaKnown RBP20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CochQ62507 552 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Enpp4Q8BTJ4 456 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mcur1Q9CXD6 340 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gdap2Q9DBL2 498 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Krt27Q9Z320 448 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tanc1Q0VGY8 1856 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sbf1Q6ZPE2 1867 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm281D3Z1Y0 860 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ccndbp1Q3TVC7 356 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adam39Q7M762 756 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam185aQ7TPD2 378 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxl5Q8C2S5 690 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Agbl2Q8CDK2 862 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ace2Q8R0I0 805 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Il36gQ8R460 164 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trim60Q8VI40 466 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 MutyhQ99P21 515 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ndufab1Q9CR21 156 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slamf8Q9D3G2 278 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dnajb7Q9QYI8 312 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gabbr1Q9WV18 960 aa20.69■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1354E9Q5G9 310 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp358E9Q8M1 571 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cyp4f40G3UW81 524 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Capn2O08529 700 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Adam19O35674 920 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Glb1P23780 647 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pou3f3P31361 497 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dlg3P70175 849 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam107bQ3TGF2 131 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfp91Q62511 572 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fcrl5Q68SN8 596 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Stk40Q7TNL3 435 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1105Q7TR58 312 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Wdr27Q8C5V5 780 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hectd2Q8CDU6 774 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Bclaf1Q8K019 919 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tbc1d16A2ABG4 766 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Patl2A2ARM1 529 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Hoxb8P09632 243 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnn2P58390 839 aa20.68■□□□□ 0.9
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eif3eP60229 445 aaKnown RBP20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 32.4 ms