RNA–Protein interactions for RNA: YBL048W

RRT1, Transcript of Protein of unknown function, yeastyeast

Gene RRT1, Length 312 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRT1YBL048W GIM4P40005 111 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W MPC1P53157 130 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W LCL1Q02786 101 aa0.07□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W ARL3Q02804 198 aa0.07□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W SEC7P11075 2009 aaKnown RBP0.07□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W TAO3P40468 2376 aa0.06□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YJL197C-AP0C5P0 93 aa0.06□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W SEC59P20048 519 aa0.06□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W GAT4P40569 121 aa0.06□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W SFT1P43682 97 aa0.06□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YDR010CQ12426 110 aa0.06□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YGL041C-BQ3E750 60 aa0.06□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W Q0144Q9ZZW2 109 aa0.06□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YRF1-6P53819 1859 aa0.05□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YPK9Q12697 1472 aa0.05□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YKL044WP36092 106 aa0.05□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W RPS20P38701 121 aaKnown RBP0.05□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W CYC2P38909 366 aa0.05□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YEA6P39953 335 aa0.05□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YIL014C-AQ02598 104 aa0.05□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W TY4B-HP0C2J7 1802 aa0.05□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W GPI19Q04082 140 aa0.04□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YDR278CQ05612 105 aa0.04□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YOR376W-AQ3E805 51 aa0.04□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W TIM8P57744 87 aa0.03□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W CNL1Q06333 122 aa0.03□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W SLO1Q3E784 85 aa0.03□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W YLR361C-AQ3E795 98 aa0.03□□□□□ -2.4
RRT1YBL048W DNA2P38859 1522 aa0.03□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W MYO2P19524 1574 aaKnown RBP0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W SNF11P38956 169 aa0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W CYB5P40312 120 aa0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YGL204CP53089 101 aa0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W MRPS12P53732 153 aa0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W SAE3P89114 91 aa0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YLR285C-AQ3E771 56 aa0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YOL164W-AQ3E7A5 60 aa0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W ECM5Q03214 1411 aa0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W COX23P38824 151 aa0.01□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YHR173CP38864 112 aa0.01□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W VPS55P47111 140 aa0.01□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W PAU12P53343 120 aa0.01□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W OST5Q92316 86 aa0.01□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YHR130CP38834 111 aa0□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YGR042WP53227 271 aa0□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YPL261CQ08976 102 aa0□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YBR072C-AQ3E794 53 aa0□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W POL2P21951 2222 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W ACP1P32463 125 aa-0.01□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W SPC24Q04477 213 aa-0.01□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YLR363W-AQ3E747 85 aa-0.01□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W PCC1Q3E833 88 aa-0.01□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W POP7P38291 140 aa-0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YER187WP40102 141 aa-0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YIR020CP40575 100 aa-0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W RPL22BP56628 122 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W DYN2Q02647 92 aa-0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W NKP2Q06162 153 aa-0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W FRQ1Q06389 190 aa-0.02□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W YLR255CO13574 117 aa-0.03□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W MRP49P32388 137 aa-0.03□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W GCV3P39726 170 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W TDA2P40045 126 aa-0.03□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W SNN1P48232 102 aa-0.03□□□□□ -2.41
RRT1YBL048W HMRA2P0CY13 119 aa-0.04□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W RPA12P32529 125 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W PAU24P38155 120 aa-0.04□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YLR118CQ12354 227 aa-0.04□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YCR099CP25657 155 aa-0.05□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W PAU2P32612 120 aa-0.05□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YIL086CP40503 102 aa-0.05□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YNL190WP53872 204 aa-0.05□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W AIM11P87275 137 aa-0.05□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W SPC2Q04969 178 aa-0.05□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W DAD1Q12248 94 aa-0.05□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YLR099W-AQ3E798 87 aa-0.05□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W RIM15P43565 1770 aa-0.05□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W RAD50P12753 1312 aa-0.06□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W CCW14O13547 238 aa-0.06□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W ADK1P07170 222 aaKnown RBP-0.06□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W SHU1P38751 150 aa-0.06□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W RPB11P38902 120 aa-0.06□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YOR097CQ12274 175 aaPredicted RBP-0.06□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YCL048W-AQ2V2Q2 79 aa-0.06□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W PAU19P0CE85 124 aa-0.07□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W PAU3P25610 124 aa-0.07□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YAR029WP39549 74 aa-0.07□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W GTT1P40582 234 aa-0.07□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W IMP2P46972 177 aa-0.07□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W VMA7P39111 118 aa-0.08□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YDR210WQ03482 75 aa-0.08□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W LSM6Q06406 86 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W COX19Q3E731 98 aa-0.08□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YLR365WQ7LIF2 110 aa-0.08□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W TOP2P06786 1428 aaKnown RBP-0.08□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W PAM16P42949 149 aa-0.09□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W RPO41P13433 1351 aaKnown RBP-0.09□□□□□ -2.42
RRT1YBL048W YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RRT1YBL048W RPS11AP0CX47 156 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
RRT1YBL048W RPS11BP0CX48 156 aaKnown RBP-0.1□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 64.7 ms