RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636621.1

LINC00598-211, long intergenic non-protein coding RNA 598, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LINC00598, Length 3,241 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00598-211ENST00000636621 CNTN2Q02246 1040 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 KCNJ11Q14654 390 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 KAZNQ674X7 775 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ARMC2Q8NEN0 867 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ACTL9Q8TC94 416 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 PTPRN2Q92932 1015 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 C12orf42Q96LP6 360 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CYTH2Q99418 400 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 NIF3L1Q9GZT8 377 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 NPHS2Q9NP85 383 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 STX18Q9P2W9 335 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 USTQ9Y2C2 406 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 PTPRFP10586 1907 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 F8W8V4 182 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SGK1O00141 431 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 KDELR1P24390 212 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SSTR1P30872 391 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 VHLP40337 213 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 RFC5P40937 340 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CCNFP41002 786 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ASPAP45381 313 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 IRGCQ6NXR0 463 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 FBXO36Q8NEA4 188 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 RFWD2Q8NHY2 731 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 C7orf26Q96N11 449 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 MSTO1Q9BUK6 570 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 XYLT2Q9H1B5 865 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ARHGEF4Q9NR80 690 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CISHQ9NSE2 258 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 KLHL11Q9NVR0 708 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 WDR35Q9P2L0 1181 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 DNAJB4Q9UDY4 337 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 LRCH1Q9Y2L9 728 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 RIPK3Q9Y572 518 aa7.26□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 IQANK1A0A1B0GTG1 560 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 K7ERI5 159 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 WNT10BO00744 389 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CHADO15335 359 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ADCY3O60266 1144 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 MAGEC1O60732 1142 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ENTPD5O75356 428 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 OATP04181 439 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 IL1R2P27930 398 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 STIP1P31948 543 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 DBN1Q16643 649 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 KIAA0319LQ8IZA0 1049 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 RTKN2Q8IZC4 609 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CPXCR1Q8N123 301 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 PDIK1LQ8N165 341 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 DNAJC9Q8WXX5 260 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 NSL1Q96IY1 281 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TSSK1BQ9BXA7 367 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 OSBPL1AQ9BXW6 950 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 IMPG2Q9BZV3 1241 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 RNF146Q9NTX7 359 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SLC17A7Q9P2U7 560 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 FBXO40Q9UH90 709 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 LRRD1A4D1F6 860 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 MSCO60682 206 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 NEBLO76041 1014 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 HAUS5O94927 633 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CST3P01034 146 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ATXN8OSP0DMR3 200 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 PROZP22891 400 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 CHRNA5P30532 468 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 PCK1P35558 622 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 GAD2Q05329 585 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 SURF1Q15526 300 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 GPAT2Q6NUI2 795 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ZNF449Q6P9G9 518 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 DCUN1D2Q6PH85 259 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 RHPN2Q8IUC4 686 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 LMNTD2Q8IXW0 634 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TTC8Q8TAM2 541 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TFAP2BQ92481 460 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 USP6NLQ92738 828 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 ZBTB45Q96K62 511 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 BCO2Q9BYV7 579 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 C1orf21Q9H246 121 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 NMRK1Q9NWW6 199 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 TELO2Q9Y4R8 837 aa7.25□□□□□ -1.25
LINC00598-211ENST00000636621 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.1 ms