RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625245.2

SMN1-211, Transcript of survival of motor neuron 1, telomeric, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene SMN1, Length 885 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMN1-211ENST00000625245 RAP1GAPP47736 663 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 PSMC1P62191 440 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 CUL4AQ13619 759 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 ZNF77Q15935 545 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 CFAP221Q4G0U5 840 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 FBXO43Q4G163 708 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 PDILTQ8N807 584 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 SPATA18Q8TC71 538 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 DDX1Q92499 740 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 CD101Q93033 1021 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 ATP2A3Q93084 1043 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 HPDLQ96IR7 371 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 SMOC1Q9H4F8 434 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 INTS13Q9NVM9 706 aa20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP20.32■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 MYO16Q9Y6X6 1858 aa20.31■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 A0A087X0B3 334 aa20.31■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 FRMD3A2A2Y4 597 aa20.31■□□□□ 0.84
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SMN1-211ENST00000625245 HDCP19113 662 aa20.31■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 LMO2P25791 158 aa20.31■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 NR1H3Q13133 447 aa20.31■□□□□ 0.84
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SMN1-211ENST00000625245 C4orf50Q6ZRC1 276 aa20.31■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 CCDC65Q8IXS2 484 aa20.31■□□□□ 0.84
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SMN1-211ENST00000625245 LINC00597Q9H2U6 94 aa20.3■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 GCNT4Q9P109 453 aa20.3■□□□□ 0.84
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SMN1-211ENST00000625245 DCLK1O15075 740 aa20.29■□□□□ 0.84
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SMN1-211ENST00000625245 DMC1Q14565 340 aa20.29■□□□□ 0.84
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SMN1-211ENST00000625245 PLK5Q496M5 336 aa20.29■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 STPG1Q5TH74 334 aa20.29■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa20.29■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 SYT13Q7L8C5 426 aa20.29■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 DPH6Q7L8W6 267 aa20.29■□□□□ 0.84
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SMN1-211ENST00000625245 ZC3H10Q96K80 434 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 MMS19Q96T76 1030 aa20.29■□□□□ 0.84
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SMN1-211ENST00000625245 ANXA13P27216 316 aa20.28■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 ELF2Q15723 593 aa20.28■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 ABCA7Q8IZY2 2146 aa20.28■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 GLIS3Q8NEA6 775 aa20.28■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa20.28■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 ACDQ96AP0 544 aa20.28■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 CRTAC1Q9NQ79 661 aa20.28■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa20.28■□□□□ 0.84
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SMN1-211ENST00000625245 NFATC1O95644 943 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 PDE6CP51160 858 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 DGKEP52429 567 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 CREB5Q02930 508 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 ST3GAL2Q16842 350 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 PLA2G2CQ5R387 149 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 VSTM1Q6UX27 236 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 RDH13Q8NBN7 331 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 SPATA17Q96L03 361 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 VPS45Q9NRW7 570 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 FOXD4L1Q9NU39 408 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 HSPBP1Q9NZL4 362 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 PTPRDP23468 1912 aa20.27■□□□□ 0.84
SMN1-211ENST00000625245 RHOBTB1O94844 696 aa20.26■□□□□ 0.83
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