RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619004.2

AC009542.2-202, humanhuman

BASIC

Gene AC009542.2, Length 1,067 nt, Biotype transcribed unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009542.2-202ENST00000619004 RMDN1Q96DB5 314 aa16.01■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CHFRQ96EP1 664 aa16.01■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 KIAA1586Q9HCI6 787 aa16.01■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 TDP1Q9NUW8 608 aa16.01■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CDH9Q9ULB4 789 aa16.01■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CACNA1AO00555 2505 aa16.01■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 EXOC3O60645 756 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CKMP06732 381 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 PRR29P0C7W0 189 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 WEE1P30291 646 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CXCL12P48061 93 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 FNTBP49356 437 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CACNA2D1P54289 1103 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 MYL6P60660 151 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 USP46P62068 366 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 TNNC1P63316 161 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 PLCB2Q00722 1185 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 STK4Q13043 487 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 C4orf50Q6ZRC1 276 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 PRR23BQ6ZRT6 265 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 MON1AQ86VX9 555 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 ARL14EPQ8N8R7 260 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 OR6B3Q8NGW1 331 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 SPATA18Q8TC71 538 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 PAGE5Q96GU1 130 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 MSANTD3Q96H12 275 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 PCED1BQ96HM7 432 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 EPC1Q9H2F5 836 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 SNX25Q9H3E2 840 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 SMYD3Q9H7B4 428 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 EXOC1Q9NV70 894 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 TMEM30AQ9NV96 361 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 POLR3BQ9NW08 1133 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CFAP45Q9UL16 551 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 WNT6Q9Y6F9 365 aa16■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CLDN5O00501 218 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 GRIK1P39086 918 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 BIRC3Q13489 604 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 TRPC3Q13507 836 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 RUNX3Q13761 415 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CCINQ13939 588 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 MTF1Q14872 753 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 WDR72Q3MJ13 1102 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 KMT5BQ4FZB7 885 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 FAM83CQ9BQN1 747 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 RCOR1Q9UKL0 485 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 ZDHHC9Q9Y397 364 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 MYOFQ9NZM1 2061 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 SPAG17Q6Q759 2223 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 SDK1Q7Z5N4 2213 aa15.99■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 F8VP50 259 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 K7ESF4 209 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 PHACTR2O75167 634 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 SLFN14P0C7P3 912 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 ANXA13P27216 316 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 GNL1P36915 607 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 MAGEA11P43364 429 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 PXNP49023 591 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 USP4Q13107 963 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 ORC1Q13415 861 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 KCNB1Q14721 858 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 ZNF77Q15935 545 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 FSTL4Q6MZW2 842 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CC2D1AQ6P1N0 951 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 DPH6Q7L8W6 267 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 SPEM1Q8N4L4 309 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 MYRFLQ96LU7 910 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 IER2Q9BTL4 223 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 XYLT2Q9H1B5 865 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 KIF9Q9HAQ2 790 aa15.98■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 EGFP01133 1207 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 CDH8P55286 799 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 DLG4P78352 724 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 FAM160A1Q05DH4 1040 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 PPP2R5DQ14738 602 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 ZNF699Q32M78 642 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 DGKKQ5KSL6 1271 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 ATL3Q6DD88 541 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 C1orf228Q6PIY5 440 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 C12orf56Q8IXR9 622 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa15.97■□□□□ 0.15
AC009542.2-202ENST00000619004 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.3 ms