RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000601392.5

CELF4-222, Transcript of CUGBP Elav-like family member 4, human

TSL 1 (best)

Gene CELF4, Length 989 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CELF4-222	ENST00000601392	H2AFV	Q71UI9	128 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM35B	Q8NCS4	154 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ACRBP	Q8NEB7	543 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	STK32A	Q8WU08	396 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	ZSWIM1	Q9BR11	485 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	PDCL3	Q9H2J4	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	MARCH5	Q9NX47	278 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	HMGXB4	Q9UGU5	601 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	WDR3	Q9UNX4	943 aa	Known RBP eCLIP	13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	CEP83	Q9Y592	693 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	NME7	Q9Y5B8	376 aa		13.53	□□□□□ -0.24
CELF4-222	ENST00000601392	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PER2	O15055	1255 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	FTL	P02792	175 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TMEM253	P0C7T8	217 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MYBL1	P10243	752 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CD19	P15391	556 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	LTBR	P36941	435 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GPD2	P43304	727 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	NOMO3	P69849	1222 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	YWHAH	Q04917	246 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	DLX2	Q07687	328 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SMARCB1	Q12824	385 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	DUSP6	Q16828	381 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PKDCC	Q504Y2	493 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TAF3	Q5VWG9	929 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	FUT10	Q6P4F1	479 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ACOT1	Q86TX2	421 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	OSTM1	Q86WC4	334 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PHF13	Q86YI8	300 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ANKRD52	Q8NB46	1076 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	RABGGTA	Q92696	567 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CYFIP2	Q96F07	1278 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TRIM11	Q96F44	468 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	IGSF21	Q96ID5	467 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	UBXN6	Q9BZV1	441 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MIS12	Q9H081	205 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PRG3	Q9Y2Y8	225 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TDRD15	B5MCY1	1934 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ZC3H11B	A0A1B0GUI2	810 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	OR6C75	A6NL08	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392		H7C4K7	107 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	TBC1D4	O60343	1298 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PDGFRB	P09619	1106 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	BRD2	P25440	801 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GALC	P54803	685 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SNX16	P57768	344 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SMAD4	Q13485	552 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	DNTTIP2	Q5QJE6	756 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ANKS3	Q6ZW76	656 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	KIAA1328	Q86T90	577 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MYCBPAP	Q8TBZ2	947 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	RTP3	Q9BQQ7	232 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GPR62	Q9BZJ7	368 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CYLD	Q9NQC7	956 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	CHST7	Q9NS84	486 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SEPT11	Q9NVA2	429 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	HESX1	Q9UBX0	185 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	SCN1A	P35498	2009 aa		13.51	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	KIF2A	O00139	706 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GLP2R	O95838	553 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MMP8	P22894	467 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ARHGAP25	P42331	645 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GABRB2	P47870	512 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GSC	P56915	257 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GPC5	P78333	572 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	USP41	Q3LFD5	358 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	INTS6L	Q5JSJ4	861 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PPP1R26	Q5T8A7	1209 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	DDX53	Q86TM3	631 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	PALB2	Q86YC2	1186 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	GPIHBP1	Q8IV16	184 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	DCP1B	Q8IZD4	617 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MCOLN2	Q8IZK6	566 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	VPS52	Q8N1B4	723 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	WDTC1	Q8N5D0	677 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	MSANTD4	Q8NCY6	345 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	HASPIN	Q8TF76	798 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	HSFY1	Q96LI6	401 aa		13.5	□□□□□ -0.25
CELF4-222	ENST00000601392	NOX5	Q96PH1	765 aa		13.5	□□□□□ -0.25

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