RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000600393.1

FCHO1-233, Transcript of FCH domain only 1, human

TSL 4

Gene FCHO1, Length 597 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FCHO1-233	ENST00000600393	IER2	Q9BTL4	223 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CUEDC2	Q9H467	287 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	FBRSL1	Q9HCM7	1045 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	DLL3	Q9NYJ7	618 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	PCDHA7	Q9UN72	937 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	HELZ	P42694	1942 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	SPAG17	Q6Q759	2223 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	MYO16	Q9Y6X6	1858 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	EGF	P01133	1207 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CKM	P06732	381 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	WARS	P23381	471 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	DDX6	P26196	483 aa	Known RBP eCLIP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	ME1	P48163	572 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	LHX1	P48742	406 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CACNA2D1	P54289	1103 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CYP27A1	Q02318	531 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	USP4	Q13107	963 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	RUNX3	Q13761	415 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	MTF1	Q14872	753 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF77	Q15935	545 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	MDH1B	Q5I0G3	518 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	DGKK	Q5KSL6	1271 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	UNC13D	Q70J99	1090 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF507	Q8TCN5	953 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF516	Q92618	1163 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	SNX21	Q969T3	373 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	TRMT2B	Q96GJ1	504 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	MYRFL	Q96LU7	910 aa		13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	R3HCC1	Q9Y3T6	440 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	ANTXRL	A6NF34	631 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	TNNI1	P19237	187 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	MYL6	P60660	151 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	LMNB2	Q03252	620 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	SIM2	Q14190	667 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	PSMD6	Q15008	389 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	TMEM196	Q5HYL7	178 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	RESP18	Q5W5W9	173 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CNNM4	Q6P4Q7	775 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	C1orf228	Q6PIY5	440 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	PCED1B	Q96HM7	432 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CNTNAP3B	Q96NU0	1288 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	FNBP1	Q96RU3	617 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF518B	Q9C0D4	1074 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	LRRC27	Q9C0I9	530 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	KIF9	Q9HAQ2	790 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	MAGEC2	Q9UBF1	373 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	SERTAD1	Q9UHV2	236 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	CDH9	Q9ULB4	789 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	EML5	Q05BV3	1969 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		13.78	□□□□□ -0.2
FCHO1-233	ENST00000600393	PRR5-ARHGAP8	B1AHC4	643 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393		F8VP50	259 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	CLDN5	O00501	218 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	ACTN4	O43707	911 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	RNF40	O75150	1001 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	UBE4B	O95155	1302 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	PAPSS2	O95340	614 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	SDHB	P21912	280 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	GRIK1	P39086	918 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	MAGEA11	P43364	429 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	ARHGAP8	P85298	464 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	ZXDB	P98169	803 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	AMPD3	Q01432	767 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	SURF1	Q15526	300 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	CCDC6	Q16204	474 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	LAIR1	Q6GTX8	287 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	KIAA1549L	Q6ZVL6	1849 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	XXYLT1	Q8NBI6	393 aa		13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.77	□□□□□ -0.21
FCHO1-233	ENST00000600393	HHIP	Q96QV1	700 aa		13.77	□□□□□ -0.21

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