RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592515.1

UBXN6-209, Transcript of UBX domain protein 6, humanhuman

TSL 5

Gene UBXN6, Length 403 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN6-209ENST00000592515 ATOH1Q92858 354 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 SPATA17Q96L03 361 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 LTB4R2Q9NPC1 389 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TMEM30AQ9NV96 361 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 OBP2AQ9NY56 170 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ZMYM5Q9UJ78 669 aa13.5□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 DMDP11532 3685 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 MYO15AQ9UKN7 3530 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 FAM170BA6NMN3 283 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 F8VP50 259 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 DPYSL4O14531 572 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 CETN3O15182 167 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 CHADO15335 359 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 KINO60870 393 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 P4HA1P13674 534 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TARSP26639 723 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ASPAP45381 313 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 PMS1P54277 932 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 CACNA2D1P54289 1103 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 USP46P62068 366 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ZNF852Q6ZMS4 543 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 MON1AQ86VX9 555 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ADSSL1Q8N142 457 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TAS1R2Q8TE23 839 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ZFYVE19Q96K21 471 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 C8orf48Q96LL4 319 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 CEP295NLQ96MC4 621 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 B3GNT5Q9BYG0 378 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 OSBPL6Q9BZF3 934 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ELOVL4Q9GZR5 314 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 MMRN2Q9H8L6 949 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 APOBEC3GQ9HC16 384 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 CCL26Q9Y258 94 aa13.49□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 PIEZO1Q92508 2521 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 SOBPA7XYQ1 873 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 CLDN5O00501 218 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TRIM66O15016 1216 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ANXA13P27216 316 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 AVPR1AP37288 418 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ANGPT1Q15389 498 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ANKRD40Q6AI12 368 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ISM2Q6H9L7 571 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 CELF5Q8N6W0 485 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 BPIFB1Q8TDL5 484 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TSG101Q99816 390 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TMEM8AQ9HCN3 771 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 HMGXB4Q9UGU5 601 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 MAN1B1Q9UKM7 699 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 PIAS3Q9Y6X2 628 aa13.48□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 COL4A2P08572 1712 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TRIM49BA6NDI0 452 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 MAN2B1O00754 1011 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 EPB41P11171 864 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 CD44P16070 742 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 GTF2H1P32780 548 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 MRE11P49959 708 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 NDST1P52848 882 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 NOP14P78316 857 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ORC1Q13415 861 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 FZD5Q13467 585 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 KRT39Q6A163 491 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 PAQR9Q6ZVX9 377 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ACOT1Q86TX2 421 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ZNF687Q8N1G0 1237 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 RIN3Q8TB24 985 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 CSGALNACT1Q8TDX6 532 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TNIP3Q96KP6 325 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 SLC22A12Q96S37 553 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 NELL2Q99435 816 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TTLL2Q9BWV7 592 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 BCO2Q9BYV7 579 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 IMPG2Q9BZV3 1241 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TRPC7Q9HCX4 862 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TDP1Q9NUW8 608 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 CHMP5Q9NZZ3 219 aa13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 C2orf78A6NCI8 922 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 SLC16A3O15427 465 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 BMP6P22004 513 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 SOX9P48436 509 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 MXI1P50539 228 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 LRRC63Q05C16 580 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 TNK2Q07912 1038 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 INCA1Q0VD86 236 aa13.46□□□□□ -0.25
UBXN6-209ENST00000592515 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.2 ms