RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589425.5

PGS1-211, Transcript of phosphatidylglycerophosphate synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PGS1, Length 1,944 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGS1-211ENST00000589425 DNA2P51530 1060 aa20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 PLCB3Q01970 1234 aa20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 TMEM110Q86TL2 294 aa20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 MSANTD4Q8NCY6 345 aa20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 STK32AQ8WU08 396 aa20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 OSBPL9Q96SU4 736 aa20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 PKMYT1Q99640 499 aa20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 MED10Q9BTT4 135 aa20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 TMLHEQ9NVH6 421 aa20.8■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 TMEM191CA6NGB0 347 aa20.79■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 MYO1FO00160 1098 aa20.79■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 ZNF185O15231 689 aa20.79■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 COMTP21964 271 aa20.79■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 EPHB4P54760 987 aa20.79■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 GSCP56915 257 aaPredicted RBP20.79■□□□□ 0.92
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PGS1-211ENST00000589425 HES6Q96HZ4 224 aa20.79■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 B3GALT6Q96L58 329 aa20.79■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 WDR35Q9P2L0 1181 aa20.79■□□□□ 0.92
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PGS1-211ENST00000589425 SIGLEC16A6NMB1 481 aa20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 NPR3P17342 541 aa20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 SYN1P17600 705 aa20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 RPL34P49207 117 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 TUBB2AQ13885 445 aa20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 FAM35AQ86V20 835 aa20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 SCUBE3Q8IX30 993 aa20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 TUBB2BQ9BVA1 445 aa20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 SELENOOQ9BVL4 669 aa20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.78■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.77■□□□□ 0.926e-6■■■■■ 117.3
PGS1-211ENST00000589425 ZBBXA8MT70 800 aa20.77■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 KRT3P12035 628 aa20.77■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP20.77■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 PLA2G4AP47712 749 aa20.77■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 CACNA2D1P54289 1103 aa20.77■□□□□ 0.92
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PGS1-211ENST00000589425 OR6B2Q6IFH4 312 aa20.77■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 DCUN1D2Q6PH85 259 aa20.77■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa20.77■□□□□ 0.92
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PGS1-211ENST00000589425 JOSD2Q8TAC2 188 aa20.77■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 MYLPFQ96A32 169 aa20.77■□□□□ 0.92
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PGS1-211ENST00000589425 SMOQ99835 787 aa20.77■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 CARD6Q9BX69 1037 aa20.77■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa20.77■□□□□ 0.92
PGS1-211ENST00000589425 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 OR4Q2P0C623 313 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 FAM200BP0CF97 657 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 TCP1P17987 556 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 FGFR3P22607 806 aa20.76■□□□□ 0.91
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PGS1-211ENST00000589425 MAP3K7CLP57077 242 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 OGDHQ02218 1023 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 PIGZQ86VD9 579 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 CAPZA3Q96KX2 299 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 KCNK16Q96T55 309 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 KRT82Q9NSB4 513 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 VWA8A3KMH1 1905 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP20.76■□□□□ 0.91
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PGS1-211ENST00000589425 AP1G2O75843 785 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 PROSCO94903 275 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 TSPY1Q01534 308 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 TAP1Q03518 808 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 TMEM240Q5SV17 173 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 CREG2Q8IUH2 290 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 LRRN4CLQ8ND94 238 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 CD101Q93033 1021 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 HSFY1Q96LI6 401 aa20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.76■□□□□ 0.911e-6■□□□□ 9.8
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PGS1-211ENST00000589425 CXXC1Q9P0U4 656 aaPredicted RBP20.76■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 KCNK3O14649 394 aa20.75■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 EFEMP2O95967 443 aa20.75■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 LCP1P13796 627 aa20.75■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 SLC8A3P57103 927 aa20.75■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 ZNF252P-AS1Q0IIN9 211 aa20.75■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 RTP2Q5QGT7 225 aa20.75■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP20.75■□□□□ 0.91
PGS1-211ENST00000589425 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP20.75■□□□□ 0.91
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