RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588419.1

HDAC5-208, Transcript of histone deacetylase 5, humanhuman

TSL 2

Gene HDAC5, Length 742 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC5-208ENST00000588419 SOWAHAQ2M3V2 549 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 PPM1JQ5JR12 505 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 FSIP1Q8NA03 581 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 C12orf50Q8NA57 414 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 RDH13Q8NBN7 331 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 RPLP0P6Q8NHW5 317 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 PKMYT1Q99640 499 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 P2RY13Q9BPV8 354 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 INTS13Q9NVM9 706 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 GDAP2Q9NXN4 497 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 HSPBP1Q9NZL4 362 aa14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 C2orf78A6NCI8 922 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 ZNF233A6NK53 670 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 ATG13O75143 517 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 ABL1P00519 1130 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 DLATP10515 647 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 BDNFP23560 247 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 LMO2P25791 158 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 ANXA13P27216 316 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 GJA4P35212 333 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 GALK1P51570 392 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 CYP2J2P51589 502 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 USP4Q13107 963 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 SF3A2Q15428 464 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 ZNF77Q15935 545 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 KBTBD6Q86V97 674 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 CXorf38Q8TB03 319 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 SH3RF2Q8TEC5 729 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 GAB3Q8WWW8 586 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 ATP2A3Q93084 1043 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 EXOC4Q96A65 974 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 ECT2Q9H8V3 914 aa14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 FBRSL1Q9HCM7 1045 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 SLC30A4O14863 429 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 CLIC2O15247 247 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 STX6O43752 255 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 TNNI1P19237 187 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 DRD1P21728 446 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 SEC13P55735 322 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 SURF1Q15526 300 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 CFAP221Q4G0U5 840 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 MDH1BQ5I0G3 518 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 IL31Q6EBC2 164 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 OSCP1Q8WVF1 389 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 CD101Q93033 1021 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 FUBP3Q96I24 572 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 TNMDQ9H2S6 317 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 SNX25Q9H3E2 840 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 CRTAC1Q9NQ79 661 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 CDH9Q9ULB4 789 aa14.66□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 NCOR2Q9Y618 2525 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 CEP192Q8TEP8 1941 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 GABRDO14764 452 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 SPTLC2O15270 562 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 HDCP19113 662 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 TNNC1P63316 161 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 DUOXA2Q1HG44 320 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 TTC30AQ86WT1 665 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 WDR49Q8IV35 697 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 OR6B3Q8NGW1 331 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 SPATA18Q8TC71 538 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 CCDC127Q96BQ5 260 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 MYRFLQ96LU7 910 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 FNBP1Q96RU3 617 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 LRRC27Q9C0I9 530 aa14.65□□□□□ -0.06
HDAC5-208ENST00000588419 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 EPN2O95208 641 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 CASP1P29466 404 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 HOXA6P31267 233 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 GBP1P32455 592 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 NASPP49321 788 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 DGKEP52429 567 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 USP46P62068 366 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 DMC1Q14565 340 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 MAPRE1Q15691 268 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 SNRNP35Q16560 246 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 EML3Q32P44 896 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 FAM26FQ5R3K3 315 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 FAM171BQ6P995 826 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 LINC00301Q8NCQ3 95 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 ACDQ96AP0 544 aa14.64□□□□□ -0.07
HDAC5-208ENST00000588419 PCED1BQ96HM7 432 aa14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.9 ms