RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587718.5

CAPNS1-204, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,558 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-204ENST00000587718 PRELID2Q8N945 189 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 KLHL23Q8NBE8 558 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF518BQ9C0D4 1074 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 CD320Q9NPF0 282 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 ACP6Q9NPH0 428 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 PCDHB4Q9Y5E5 795 aa26.9■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 GRXCR2A6NFK2 248 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 DAPK3O43293 454 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 PPFIA2O75334 1257 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 PTGIRP43119 386 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 EIF3BP55884 814 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 WNT7BP56706 349 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 NOMO3P69849 1222 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 HYAL1Q12794 435 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 DRP2Q13474 957 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM187BQ17R55 369 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 MPZL3Q6UWV2 235 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 JAMLQ86YT9 394 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 LRRC19Q9H756 370 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.89■■□□□ 1.9
CAPNS1-204ENST00000587718 GOLGA6L10A6NI86 522 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 H3BQ06 376 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 IL18RAPO95256 599 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 EDN1P05305 212 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 GNA15P30679 374 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ZSCAN26Q16670 478 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 KYAT1Q16773 422 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CROCCP2Q86T23 111 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 PTPRHQ9HD43 1115 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 HOMER3Q9NSC5 361 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ANAPC7Q9UJX3 599 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO7AQ13402 2215 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 MYO1FO00160 1098 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 PSTPIP1O43586 416 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 PROSCO94903 275 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 DARSP14868 501 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 IL9P15248 144 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 HSD17B3P37058 310 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 PLEKHA7Q6IQ23 1121 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TMC3Q7Z5M5 1100 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 MAGOHBQ96A72 148 aaKnown RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 FMO2Q99518 471 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TXLNGYQ9BZA5 131 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 NR2E1Q9Y466 385 aa26.88■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 PYGMP11217 842 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TRADDQ15628 312 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 PUS10Q3MIT2 529 aaKnown RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TTMPQ5BVD1 217 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 KDM7AQ6ZMT4 941 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF149Q8NC42 400 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 OR5B17Q8NGF7 314 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 NIF3L1Q9GZT8 377 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 UTP3Q9NQZ2 479 aaKnown RBP eCLIP26.87■■□□□ 1.891e-21■■■■■ 79.2
CAPNS1-204ENST00000587718 CLDND1Q9NY35 253 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 PLAAQ9Y263 795 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TNFSF13BQ9Y275 285 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 NUB1Q9Y5A7 615 aa26.87■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TBKBP1A7MCY6 615 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 AGBL2Q5U5Z8 902 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 LMBRD2Q68DH5 695 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TCHPQ9BT92 498 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TMBIM4Q9HC24 238 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 RNF19AQ9NV58 838 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 PRMT7Q9NVM4 692 aaPredicted RBP26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 NFS1Q9Y697 457 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 KIAA1671Q9BY89 1806 aa26.86■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ERICH4A6NGS2 130 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 FGFR1P11362 822 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 IRS1P35568 1242 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 COILP38432 576 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 MARCKSL1P49006 195 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 SIX1Q15475 284 aaPredicted RBP26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 NAA35Q5VZE5 725 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 TMEM270Q6UE05 265 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 POF1BQ8WVV4 589 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ARL8AQ96BM9 186 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 ADAM22Q9P0K1 906 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 HCSTQ9UBK5 93 aa26.85■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CALB1P05937 261 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 RRM1P23921 792 aa26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 DLX2Q07687 328 aaPredicted RBP26.84■■□□□ 1.89
CAPNS1-204ENST00000587718 CYFIP2Q96F07 1278 aa26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22 ms