RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000579859.1

TSPOAP1-AS1-204, TSPOAP1, SUPT4H1 and RNF43 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TSPOAP1-AS1, Length 1,791 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PDGFRBP09619 1106 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 WARSP23381 471 aaKnown RBP27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LMO2P25791 158 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RAB27AP51159 221 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LPIN1Q14693 890 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZFYVE27Q5T4F4 411 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ALS2CLQ60I27 953 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PMF1Q6P1K2 205 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM183BPQ6ZVS7 135 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LPPQ93052 612 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC4A5Q9BY07 1137 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DCLK3Q9C098 648 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HOMER3Q9NSC5 361 aa27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP27.85■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LRCH4O75427 683 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 THP07101 528 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KCNJ1P48048 391 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 COPS2P61201 443 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ACAP1Q15027 740 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OR6B2Q6IFH4 312 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AGMOQ6ZNB7 445 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM71BQ8TC56 605 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 STK32AQ8WU08 396 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CHST7Q9NS84 486 aa27.84■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MOXD2PA6NHM9 499 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AGPSO00116 658 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF623O75123 536 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ECEL1O95672 775 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM163BP0C2L3 166 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RGS7P49802 495 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 DSC3Q14574 896 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZBTB9Q96C00 473 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LPIN3Q9BQK8 851 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ARL5CA6NH57 179 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PI4K2BG5E9Z4 385 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TULP2O00295 520 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTPN7P35236 360 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GGCXP38435 758 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SNX16P57768 344 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PDE4CQ08493 712 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HADHQ16836 314 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MFSD7Q6UXD7 560 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TMEM110Q86TL2 294 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GLT1D1Q96MS3 346 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MCOLN1Q9GZU1 580 aa27.83■■■□□ 2.05
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PIK3R2O00459 728 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MGEA5O60502 916 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SYF2O95926 243 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 KRT7P08729 469 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCDC130P13994 396 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GBP1P32455 592 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BCAT1P54687 386 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ODF2Q5BJF6 829 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OSTM1Q86WC4 334 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ANKRD52Q8NB46 1076 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ATG4AQ8WYN0 398 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LRRC45Q96CN5 670 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 TNIP3Q96KP6 325 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ASNSD1Q9NWL6 643 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 MIOSQ9NXC5 875 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 R3HDM2Q9Y2K5 976 aaKnown RBP27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SNX24Q9Y343 169 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SQORQ9Y6N5 450 aa27.82■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CYB561D2O14569 222 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 HSF2BPO75031 334 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CAND2O75155 1236 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 INHAP05111 366 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GPD1P21695 349 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 BST2Q10589 180 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SNX1Q13596 522 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 CCNG2Q16589 344 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RAPGEF5Q92565 580 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PTPN22Q9Y2R2 807 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 C2CD4BA6NLJ0 364 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ADORA2BP29275 332 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FAM193AP78312 1265 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 OLFML1Q6UWY5 402 aa27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 PIWIL1Q96J94 861 aaKnown RBP27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP27.81■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 A0A0U1RQF3 1178 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 LRRD1A4D1F6 860 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RNF8O76064 485 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 IL1R2P27930 398 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 RPL21P46778 160 aaKnown RBP27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SCNN1GP51170 649 aa27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP27.8■■■□□ 2.04
TSPOAP1-AS1-204ENST00000579859 ZDHHC17Q8IUH5 632 aa27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.7 ms