RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 STT3AP46977 705 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CASP5P51878 434 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF543Q08ER8 600 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 DLGAP5Q15398 846 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CNGA2Q16280 664 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MYRIPQ8NFW9 859 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 STON2Q8WXE9 905 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 LCORQ96JN0 433 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 HERPUD2Q9BSE4 406 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 JADE2Q9NQC1 790 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MOCS1Q9NZB8 636 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PADI4Q9UM07 663 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHA6Q9UN73 950 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ZDHHC9Q9Y397 364 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 POM121BA6NF01 834 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 WNT10BO00744 389 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 JUNP05412 331 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 GJB1P08034 283 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 HALP42357 657 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 RAP1GAPP47736 663 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PPM1FP49593 454 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 SLURP1P55000 103 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 BPIFB4P59827 614 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CTXN1P60606 82 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ATP8B2P98198 1209 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CREMQ03060 361 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CRHR2Q13324 411 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 TRIM14Q14142 442 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ACAP1Q15027 740 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PDCD2Q16342 344 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 VMACQ2NL98 169 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 GAGE13Q4V321 117 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 FAM209BQ5JX69 171 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 DGKKQ5KSL6 1271 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 XP32Q5T750 250 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 IZUMO3Q5VZ72 239 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 COPS6Q7L5N1 327 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM151BQ8IW70 566 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ZDHHC14Q8IZN3 488 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC33Q8N5R6 958 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 REPS2Q8NFH8 660 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CD99L2Q8TCZ2 262 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CFHR4Q92496 578 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 SUCLG2Q96I99 432 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CRB3Q9BUF7 120 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ENKD1Q9H0I2 346 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 HYPKQ9NX55 129 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 TSPYL4Q9UJ04 414 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 RTL9Q8NET4 1388 aa6.38□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MROH6A6NGR9 719 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MYO1FO00160 1098 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ARHGAP6O43182 974 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 NBNO60934 754 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CD1AP06126 327 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CETPP11597 493 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PAX3P23760 479 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PRDX5P30044 214 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 GUCY1A2P33402 732 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 SUMO3P55854 103 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 FMO1Q01740 532 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 SP140Q13342 867 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MTM1Q13496 603 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 RNF151Q2KHN1 245 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRM-208ENST00000578600 LIX1LQ8IVB5 337 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 OR5M3Q8NGP4 307 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 OR14K1Q8NGZ2 314 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MDM1Q8TC05 714 aa6.37□□□□□ -1.39
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PTPRM-208ENST00000578600 WDR12Q9GZL7 423 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 GPRC5BQ9NZH0 403 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 NCDNQ9UBB6 729 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 ACTL7AQ9Y615 435 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa6.37□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 MED23Q9ULK4 1368 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 FAM205AQ6ZU69 1335 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.36□□□□□ -1.39
PTPRM-208ENST00000578600 NT5C1B-RDH14C9J2C7 533 aa6.36□□□□□ -1.39
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