RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC169A6NNP5 214 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 M0R3H8 397 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PDLIM1O00151 329 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 EBAG9O00559 213 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NDUFAB1O14561 156 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 AREL1O15033 823 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 YKT6O15498 198 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ARHGAP6O43182 974 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FRS3O43559 492 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 AHCYL1O43865 530 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 BRINP1O60477 761 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PDE8AO60658 829 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MAFO75444 373 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ABLIM3O94929 683 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SLITRK3O94933 977 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NPPAP01160 153 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PYGLP06737 847 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DLATP10515 647 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 AKR1B1P15121 316 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM11P17152 192 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ARF4P18085 180 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TFEBP19484 476 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GRK6P43250 576 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ETV4P43268 484 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 IFNAR2P48551 515 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 KPNA1P52294 538 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CLNS1AP54105 237 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CCNA1P78396 465 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MRPS21P82921 87 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 IL1RL1Q01638 556 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 KLHL30Q0D2K2 578 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MAJINQ3KP22 176 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TUBB8Q3ZCM7 444 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MMEL1Q495T6 779 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MINDY4Q4G0A6 757 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 Q4G0T1 1027 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC38Q502W7 563 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 KRTCAP3Q53RY4 240 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 AADACL4Q5VUY2 407 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 LAIR1Q6GTX8 287 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RAB12Q6IQ22 244 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 C8orf74Q6P047 294 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 KLC3Q6P597 504 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FAM47EQ6ZV65 393 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TAOK1Q7L7X3 1001 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF804AQ7Z570 1209 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NECAB2Q7Z6G3 386 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RNF180Q86T96 592 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SGMS1Q86VZ5 419 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NIM1KQ8IY84 436 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TMCO5AQ8N6Q1 288 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 IL17RDQ8NFM7 739 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 OR6C4Q8NGE1 309 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RFWD2Q8NHY2 731 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FAM81AQ8TBF8 368 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 DENND1AQ8TEH3 1009 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 FERMT2Q96AC1 680 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TTC17Q96AE7 1141 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MAML3Q96JK9 1138 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CATSPER2Q96P56 530 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ASB2Q96Q27 587 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PSKH2Q96QS6 385 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MYD88Q99836 296 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CHCHD6Q9BRQ6 235 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ZPBPQ9BS86 351 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NTPCRQ9BSD7 190 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ISCA1Q9BUE6 129 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 APOL5Q9BWW9 433 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GLT8D2Q9H1C3 349 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 SERHL2Q9H4I8 314 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 HOMER3Q9NSC5 361 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 NSMCE4AQ9NXX6 385 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ATPIF1Q9UII2 106 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GJD2Q9UKL4 321 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 AGO2Q9UKV8 859 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CRYL1Q9Y2S2 319 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TMED5Q9Y3A6 229 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 MSRB2Q9Y3D2 182 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 A0A087X0B3 334 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CTAGE9A4FU28 777 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 RRN3P2A6NIE6 340 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 ENO4A6NNW6 628 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 H7C0S8 307 aa3.28□□□□□ -1.88
PTPRM-204ENST00000577468 CAPN9O14815 690 aa3.28□□□□□ -1.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms