RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574217.1

PRPF8-210, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 310 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-210ENST00000574217 SLC39A12Q504Y0 691 aa7.1□□□□□ -1.27
PRPF8-210ENST00000574217 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
PRPF8-210ENST00000574217 TAF3Q5VWG9 929 aa7.1□□□□□ -1.27
PRPF8-210ENST00000574217 ARHGAP17Q68EM7 881 aa7.1□□□□□ -1.27
PRPF8-210ENST00000574217 FAM171BQ6P995 826 aa7.1□□□□□ -1.27
PRPF8-210ENST00000574217 C4orf50Q6ZRC1 276 aa7.1□□□□□ -1.27
PRPF8-210ENST00000574217 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa7.1□□□□□ -1.27
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PRPF8-210ENST00000574217 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
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PRPF8-210ENST00000574217 THEGQ9P2T0 379 aa7.09□□□□□ -1.27
PRPF8-210ENST00000574217 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.09□□□□□ -1.27
PRPF8-210ENST00000574217 PCDHGC3Q9UN70 934 aa7.09□□□□□ -1.27
PRPF8-210ENST00000574217 COG5Q9UP83 839 aa7.09□□□□□ -1.27
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PRPF8-210ENST00000574217 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PRPF8-210ENST00000574217 A0A087X0T9 212 aa7.08□□□□□ -1.28
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