RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574205.5

CTDNEP1-209, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

TSL 5

Gene CTDNEP1, Length 1,506 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR15P49685 360 aa35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 KLK7P49862 253 aa35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 FANCCQ00597 558 aa35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 SHC3Q92529 594 aa35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 AJAP1Q9UKB5 411 aaPredicted RBP35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 FHOD1Q9Y613 1164 aa35.14■■■■□ 3.22
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLUHO75153 1309 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 RNF225M0QZC1 329 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 BMP1P13497 986 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF132P52740 706 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 PABPC1LQ4VXU2 614 aaKnown RBP35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 C8orf48Q96LL4 319 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 CORO1BQ9BR76 489 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT82Q9NSB4 513 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOTCH4Q99466 2003 aa35.13■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TEX33O43247 280 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 RHOP08100 348 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 VDRP11473 427 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 KRT5P13647 590 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANXA13P27216 316 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 ADORA2BP29275 332 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 SGO2Q562F6 1265 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 ARHGAP17Q68EM7 881 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 LEMD2Q8NC56 503 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR152Q8TDT2 470 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 GIPC2Q8TF65 315 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 SPATA17Q96L03 361 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMEM30AQ9NV96 361 aa35.12■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 F8VP50 259 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 AP1G2O75843 785 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSH1P0DML2 217 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSH2P0DML3 217 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 CACNA2D1P54289 1103 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 SDHAF4Q5VUM1 108 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 GANQ9H2C0 597 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 AVENQ9NQS1 362 aaPredicted RBP35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 ASAH2Q9NR71 780 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 FAM200BP0CF97 657 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 CD19P15391 556 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 NTHL1P78549 312 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 RAPGEF1Q13905 1077 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TAF12Q16514 161 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANP32EQ9BTT0 268 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa35.11■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 NOL4O94818 638 aa35.1■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHA5P54756 1037 aa35.1■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 UBASH3AP57075 661 aa35.1■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 NR1I3Q14994 352 aa35.1■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TJAP1Q5JTD0 557 aa35.1■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 CYP4A22Q5TCH4 519 aa35.1■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 GREB1Q4ZG55 1949 aa35.09■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 PDZD4Q76G19 769 aaPredicted RBP35.09■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 NEK11Q8NG66 645 aa35.09■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 KCNK16Q96T55 309 aa35.09■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRKAG3Q9UGI9 489 aa35.09■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP35.09■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 USP8P40818 1118 aa35.08■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP35.08■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TMC8Q8IU68 726 aa35.08■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 HS6ST3Q8IZP7 471 aa35.08■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 LRRC3Q9BY71 257 aa35.08■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 STK33Q9BYT3 514 aa35.08■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 A0A1W2PQC6 194 aa35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC38A8A6NNN8 435 aa35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 FSHRP23945 695 aa35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 CLEC20AQ6ZU45 233 aa35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 SMOQ99835 787 aa35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 GPR88Q9GZN0 384 aa35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 TSPAN16Q9UKR8 245 aa35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 USTQ9Y2C2 406 aa35.07■■■■□ 3.21
CTDNEP1-209ENST00000574205 O00370 1275 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FOXN3O00409 490 aaPredicted RBP35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZNF197O14709 1029 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 EPHB6O15197 1021 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 BEST1O76090 585 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 NPR3P17342 541 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 STILQ15468 1287 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 STKLD1Q8NE28 680 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ZMIZ2Q8NF64 920 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TFAP2BQ92481 460 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 DUSP16Q9BY84 665 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 FGF19O95750 216 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 MAP3K7CLP57077 242 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 MTMR3Q13615 1198 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 SLC5A9Q2M3M2 681 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 PRSS36Q5K4E3 855 aa35.06■■■■□ 3.2
CTDNEP1-209ENST00000574205 ANKRD52Q8NB46 1076 aa35.06■■■■□ 3.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.1 ms