RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560725.1

TMOD3-208, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 4

Gene TMOD3, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-208ENST00000560725 TRIM63Q969Q1 353 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 LRRC37BQ96QE4 947 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ISCA1Q9BUE6 129 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CNPPD1Q9BV87 410 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 PLA2G12BQ9BX93 195 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 MYLK2Q9H1R3 596 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 GSTO2Q9H4Y5 243 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TM7SF3Q9NS93 570 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF212Q9UDV6 495 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SLC45A2Q9UMX9 530 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.94□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ITSN1Q15811 1721 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 AREL1O15033 823 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 PLSCR1O15162 318 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TLR5O60602 858 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 INMTO95050 263 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 AGFG2O95081 481 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 UCP3P55916 312 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TCF15Q12870 199 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 GRM1Q13255 1194 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 BIRC3Q13489 604 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 AMOTQ4VCS5 1084 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CRB2Q5IJ48 1285 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 FAM160B1Q5W0V3 765 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 UNC13DQ70J99 1090 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 YAF2Q8IY57 180 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SLC15A4Q8N697 577 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 POU5F2Q8N7G0 328 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TMIEQ8NEW7 156 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 DNERQ8NFT8 737 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 OR52N2Q8NGI0 321 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 OR56A3Q8NH54 315 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CYP2W1Q8TAV3 490 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TBC1D15Q8TC07 691 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ST8SIA2Q92186 375 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SPSB4Q96A44 273 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 MOGAT1Q96PD6 335 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 DGKBQ9Y6T7 804 aa6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 MFAP3LO75121 409 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 PPFIA4O75335 1185 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TXNP10599 105 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 VIPR2P41587 438 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 GRM7Q14831 915 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 NT5DC1Q5TFE4 455 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 DCAF12L1Q5VU92 463 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SLFN13Q68D06 897 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 MYCT1Q8N699 235 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 NUP133Q8WUM0 1156 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 KLHL32Q96NJ5 620 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 STK31Q9BXU1 1019 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 MEGF9Q9H1U4 602 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CHST8Q9H2A9 424 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 USP40Q9NVE5 1235 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 HECAQ9UBI9 543 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SLC39A10Q9ULF5 831 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CAMTA1Q9Y6Y1 1673 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 TTC21AQ8NDW8 1320 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 USP6P35125 1406 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CRB1P82279 1406 aa6.92□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 RGPD1P0DJD0 1748 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 LAMTOR5O43504 91 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ITGB1P05556 798 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CYP2C9P11712 490 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 IL1R2P27930 398 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 RENBPP51606 427 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 PIGFQ07326 219 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 FSTL1Q12841 308 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ELAVL1Q15717 326 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 OGFOD2Q6N063 350 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 RNF169Q8NCN4 708 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SLC17A8Q8NDX2 589 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 MDGA1Q8NFP4 955 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 MUL1Q969V5 352 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 RMDN3Q96TC7 470 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 MAGEB5Q9BZ81 275 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 IMPG2Q9BZV3 1241 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 SPON1Q9HCB6 807 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 XPR1Q9UBH6 696 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 HDAC9Q9UKV0 1011 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa6.91□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 LRP5O75197 1615 aa6.9□□□□□ -1.3
TMOD3-208ENST00000560725 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.9□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms