RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560359.1

GABPB1-AS1-204, GABPB1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene GABPB1-AS1, Length 709 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZNF512Q96ME7 567 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZMIZ2Q8NF64 920 aa25.4■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 SPAG5Q96R06 1193 aa25.4■■□□□ 1.66
GABPB1-AS1-204ENST00000560359 ZSWIM1Q9BR11 485 aa25.4■■□□□ 1.66
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GABPB1-AS1-204ENST00000560359 CYP26A1O43174 497 aa25.39■■□□□ 1.66
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