RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552331.1

CS-232, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-232ENST00000552331 TSC22D2O75157 780 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PALMO75781 387 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PRAMEF1O95521 474 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 METTL18O95568 372 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 WNT11O96014 354 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 HEXBP07686 556 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PDHA1P08559 390 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 COL6A2P12110 1019 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 IFNGR1P15260 489 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 NPPBP16860 134 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SP100P23497 879 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SDHAP31040 664 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 GP5P40197 560 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 BUD31P41223 144 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CARSP49589 748 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 GALK1P51570 392 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PPP5CP53041 499 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PNLIPRP1P54315 467 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 RPL11P62913 178 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 RPP30P78346 268 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SCAPQ12770 1279 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ADAM9Q13443 819 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 AOC3Q16853 763 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SMU1Q2TAY7 513 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CYP27C1Q4G0S4 372 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 FAM69AQ5T7M9 428 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 FYB2Q5VWT5 728 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 RRAGBQ5VZM2 374 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 UNC13DQ70J99 1090 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 IKBIPQ70UQ0 350 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TMC3Q7Z5M5 1100 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TMEM110Q86TL2 294 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 VSIG10LQ86VR7 867 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CLEC10AQ8IUN9 316 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SCN4BQ8IWT1 228 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 FAM20CQ8IXL6 584 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 IQCF2Q8IXL9 164 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CCDC105Q8IYK2 499 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 FBXL6Q8N531 539 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DPP10Q8N608 796 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ZBTB44Q8NCP5 570 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DENND6BQ8NEG7 585 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 MNS1Q8NEH6 495 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 IPMKQ8NFU5 416 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SCAMP5Q8TAC9 235 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ZNF384Q8TF68 577 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 EZH1Q92800 747 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 FAM162AQ96A26 154 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 VPS33AQ96AX1 596 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SIPA1Q96FS4 1042 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 APOPT1Q96IL0 206 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CLPTM1LQ96KA5 538 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 MRGPRX1Q96LB2 322 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 MYRFLQ96LU7 910 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 RBM15Q96T37 977 aaKnown RBP eCLIP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ATP6V0BQ99437 205 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PAIP2Q9BPZ3 127 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DUSP23Q9BVJ7 150 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 NT5C3AQ9H0P0 336 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CDIP1Q9H305 208 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 NDST4Q9H3R1 872 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 SMARCAD1Q9H4L7 1026 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 WDCPQ9H6R7 721 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 RMI1Q9H9A7 625 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 VPS37BQ9H9H4 285 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CHODLQ9H9P2 273 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DECR2Q9NUI1 292 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TBC1D23Q9NUY8 699 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 HOXC10Q9NYD6 342 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 PLA2G3Q9NZ20 509 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 COQ3Q9NZJ6 369 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 STOML1Q9UBI4 398 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CACNG4Q9UBN1 327 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 ZNF212Q9UDV6 495 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 MINPP1Q9UNW1 487 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 CAMK2AQ9UQM7 478 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 DERAQ9Y315 318 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 HS3ST4Q9Y661 456 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 FAM169AQ9Y6X4 670 aa3.81□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 A8MVJ9 347 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 B8ZZF3 427 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 H0YAE9 185 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 H0YC42 278 aa3.8□□□□□ -1.8
CS-232ENST00000552331 BOLA2-SMG1P6H3BVE0 249 aa3.8□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms