RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551931.5

LETMD1-231, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

TSL 3

Gene LETMD1, Length 705 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-231	ENST00000551931	PML	P29590	882 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	AMPD2	Q01433	879 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	EML3	Q32P44	896 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SYT13	Q7L8C5	426 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CSGALNACT2	Q8N6G5	542 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ARL14EP	Q8N8R7	260 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CD101	Q93033	1021 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CHAMP1	Q96JM3	812 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CLIC6	Q96NY7	704 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	MTMR12	Q9C0I1	747 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	DUSP15	Q9H1R2	295 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM206	Q9H813	350 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GCNT4	Q9P109	453 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ITGA11	Q9UKX5	1188 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		13.5	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS37C	A5D8V6	355 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ANTXRL	A6NF34	631 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GABRD	O14764	452 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP2C2	O75185	946 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	KRT19	P08727	400 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GART	P22102	1010 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	IFNAR2	P48551	515 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	DMC1	Q14565	340 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SOWAHA	Q2M3V2	549 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	FBXO43	Q4G163	708 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	RRAGB	Q5VZM2	374 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SCN4B	Q8IWT1	228 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CACTIN	Q8WUQ7	758 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ATP2A3	Q93084	1043 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	OLFML3	Q9NRN5	406 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	VPS45	Q9NRW7	570 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CCDC39	Q9UFE4	941 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ANGPTL2	Q9UKU9	493 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		13.49	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931		A0A087X0B3	334 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	FRMD3	A2A2Y4	597 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	APBB3	O95704	486 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	LDHA	P00338	332 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	IDE	P14735	1019 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	LHX1	P48742	406 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PSMC1	P62191	440 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	RBP5	P82980	135 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ZXDB	P98169	803 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PSMD2	Q13200	908 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM173B	Q6P4H8	233 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	FAM171B	Q6P995	826 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SV2B	Q7L1I2	683 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SYCP3	Q8IZU3	236 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TOP6BL	Q8N6T0	577 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SPATA18	Q8TC71	538 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	KBTBD7	Q8WVZ9	684 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	LSM14B	Q9BX40	385 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	LINC00597	Q9H2U6	94 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SRPRB	Q9Y5M8	271 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SPEG	Q15772	3267 aa		13.48	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PCNX2	A6NKB5	2137 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNK5	O95279	499 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TMEM191B	P0C7N4	346 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	TCF3	P15923	654 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	HDC	P19113	662 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	LMO2	P25791	158 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PCSK1	P29120	753 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	OPRD1	P41143	372 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	MAGEA11	P43364	429 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	USP46	P62068	366 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CREB5	Q02930	508 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	KCNB1	Q14721	858 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GAB4	Q2WGN9	574 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	RNF43	Q68DV7	783 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	LIMS2	Q7Z4I7	341 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GPD1L	Q8N335	351 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	GLIS3	Q8NEA6	775 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	OR5B17	Q8NGF7	314 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	MYLPF	Q96A32	169 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ACD	Q96AP0	544 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	SYT15	Q9BQS2	421 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CRTAC1	Q9NQ79	661 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	INTS13	Q9NVM9	706 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	EBF1	Q9UH73	591 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ARHGAP26	Q9UNA1	814 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	INVS	Q9Y283	1065 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		13.47	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	CACNA1G	O43497	2377 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	ZFYVE26	Q68DK2	2539 aa		13.46	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
LETMD1-231	ENST00000551931		K7EQS6	105 aa		13.46	□□□□□ -0.25

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