RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550632.5

USP15-216, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 3

Gene USP15, Length 728 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-216ENST00000550632 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 FCRL3Q96P31 734 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 PI4K2AQ9BTU6 479 aa15.99■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 TMEM134Q9H6X4 195 aa15.99■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 KMT5AQ9NQR1 393 aa15.99■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 TMLHEQ9NVH6 421 aa15.99■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa15.99■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CYP8B1Q9UNU6 501 aa15.99■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 IGHV1OR15-9A0A0B4J2B8 117 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 A0A1W2PQD8 194 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 TTC26A0AVF1 554 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 C2orf78A6NCI8 922 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 LACTBL1A8MY62 500 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 SLC16A4O15374 487 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 KAT7O95251 611 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CYP17A1P05093 508 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 KIR2DL1P43626 348 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CFHR1Q03591 330 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 DDR2Q16832 855 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 SLC36A4Q6YBV0 504 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 DAW1Q8N136 415 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 SPPL2BQ8TCT7 592 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 HAPLN2Q9GZV7 340 aa15.98■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 STK36Q9NRP7 1315 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 MYMKA6NI61 221 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 XBP1P17861 261 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CYP3A5P20815 502 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 RPA1P27694 616 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 KRT2P35908 639 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 WASP42768 502 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.156e-7■■■□□ 18.8
USP15-216ENST00000550632 ZXDBP98169 803 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 PCSK4Q6UW60 755 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 SKAP1Q86WV1 359 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 PNKPQ96T60 521 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CLMPQ9H6B4 373 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 TMEM206Q9H813 350 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CD93Q9NPY3 652 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 GCNT4Q9P109 453 aa15.97■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 SFI1A8K8P3 1242 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CAPN9O14815 690 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 HIP1RO75146 1068 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 TOM1L1O75674 476 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 APODP05090 189 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CYP11A1P05108 521 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CSH1P0DML2 217 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 CSH2P0DML3 217 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 PPP2R3AQ06190 1150 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 WSCD1Q658N2 575 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 C2orf15Q8WU43 125 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 FAM212AQ96EL1 285 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 PLEKHA5Q9HAU0 1116 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 PCDHB5Q9Y5E4 795 aa15.96■□□□□ 0.15
USP15-216ENST00000550632 PLK4O00444 970 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 CYB561D2O14569 222 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 DKK1O94907 266 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 CLTAP09496 248 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 MCM7P33993 719 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 RESTQ13127 1097 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 DHCR24Q15392 516 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 C9orf57Q5W0N0 161 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 METTL23Q86XA0 190 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 THEM5Q8N1Q8 247 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 ERMNQ8TAM6 284 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 SPATA18Q8TC71 538 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 RHBDD1Q8TEB9 315 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 ARHGEF4Q9NR80 690 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 MYO18AQ92614 2054 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 BTBD18B2RXH4 712 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 CLDN3O15551 220 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 HDCP19113 662 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 PSMA5P28066 241 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 FOSBP53539 338 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 MCL1Q07820 350 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 SCRN1Q12765 414 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 KCNB1Q14721 858 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 SPATA1Q5VX52 437 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 JADE1Q6IE81 842 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 SLC6A17Q9H1V8 727 aa15.94■□□□□ 0.14
USP15-216ENST00000550632 FAM124BQ9H5Z6 455 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 82.1 ms