RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549123.5

TCTN1-222, Transcript of tectonic family member 1, human

TSL 2

Gene TCTN1, Length 458 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC4A8	Q2Y0W8	1093 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC62	Q6P9F0	684 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CASC1	Q6TDU7	716 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ERO1B	Q86YB8	467 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	LYSMD2	Q8IV50	215 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ATXN2L	Q8WWM7	1075 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ST8SIA2	Q92186	375 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	DYNLL2	Q96FJ2	89 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CCDC17	Q96LX7	622 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	IL25	Q9H293	177 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF287	Q9HBT7	754 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	EVL	Q9UI08	416 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ANAPC4	Q9UJX5	808 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	AFG3L2	Q9Y4W6	797 aa		5.07	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	AKAP11	Q9UKA4	1901 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	SMIM22	K7EJ46	135 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF213	O14771	459 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	STC2	O76061	302 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	GH2	P01242	217 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ASNS	P08243	561 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	LTA4H	P09960	611 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ID4	P47928	161 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	TM4SF4	P48230	202 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	NT5C2	P49902	561 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	HMGA2	P52926	109 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	SREBF2	Q12772	1141 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	STRN3	Q13033	797 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	KLF10	Q13118	480 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	GRM1	Q13255	1194 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	TRIM25	Q14258	630 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	PDCD1	Q15116	288 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ABCB5	Q2M3G0	1257 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	DCAF17	Q5H9S7	520 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	PITRM1	Q5JRX3	1037 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF444	Q8N0Y2	327 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	MB21D1	Q8N884	522 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	SLC44A5	Q8NCS7	719 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	MAP4K1	Q92918	833 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ACAP3	Q96P50	834 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	MNT	Q99583	582 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	PDCD2L	Q9BRP1	358 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	AS3MT	Q9HBK9	375 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CDY2A	Q9Y6F7	541 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ZHX2	Q9Y6X8	837 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	MAST2	Q6P0Q8	1798 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		5.06	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	C19orf81	C9J6K1	198 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ORC4	O43929	436 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	BRINP1	O60477	761 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	PC	P11498	1178 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CETP	P11597	493 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	GYPE	P15421	78 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	MAK	P20794	623 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	GUCY1A2	P33402	732 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CASR	P41180	1078 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	MASP1	P48740	699 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	DUSP2	Q05923	314 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	SNAPC2	Q13487	334 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	TOB2	Q14106	344 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	UGT8	Q16880	541 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	C19orf54	Q5BKX5	351 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CT83	Q5H943	113 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	AKNAD1	Q5T1N1	836 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	FNDC7	Q5VTL7	733 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	TMEM179	Q6ZVK1	233 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	STRA8	Q7Z7C7	330 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	AMER2	Q8N7J2	671 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	UBR7	Q8N806	425 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CLRN3	Q8NCR9	226 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	STAG1	Q8WVM7	1258 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	IL17RA	Q96F46	866 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	PAWR	Q96IZ0	340 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	KCTD10	Q9H3F6	313 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	RNF41	Q9H4P4	317 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	TOPORS	Q9NS56	1045 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	ZBTB21	Q9ULJ3	1066 aa		5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	5.05	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	DOCK2	Q92608	1830 aa		5.04	□□□□□ -1.6
TCTN1-222	ENST00000549123	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		5.04	□□□□□ -1.6

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