RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533897.1

CTSC-208, Transcript of cathepsin C, human

TSL 2

Gene CTSC, Length 4,344 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTSC-208	ENST00000533897	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CCDC125	Q86Z20	511 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	WDR49	Q8IV35	697 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ANKRD42	Q8N9B4	389 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	JOSD2	Q8TAC2	188 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PLVAP	Q9BX97	442 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ADAM33	Q9BZ11	813 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	POPDC2	Q9HBU9	364 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SAYSD1	Q9NPB0	183 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C1orf112	Q9NSG2	853 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GABBR1	Q9UBS5	961 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SIX4	Q9UIU6	781 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NME7	Q9Y5B8	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GSTTP1	A0A1W2PQM5	241 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CLRN2	A0PK11	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ENTPD5	O75356	428 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TJP3	O95049	919 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KRT4	P19013	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	EIF2AK2	P19525	551 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CDC25C	P30307	473 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TNFSF9	P41273	254 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NSF	P46459	744 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ACTR2	P61160	394 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TAP1	Q03518	808 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PIGH	Q14442	188 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	EMC2	Q15006	297 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RAB6C	Q53S08	254 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LMBRD2	Q68DH5	695 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZPBP2	Q6X784	338 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CYS1	Q717R9	158 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NLRP9	Q7RTR0	991 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MAVS	Q7Z434	540 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PRPF39	Q86UA1	669 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MYLK4	Q86YV6	388 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TREML1	Q86YW5	311 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GADD45GIP1	Q8TAE8	222 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C7orf26	Q96N11	449 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LRRC37B	Q96QE4	947 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZNF341	Q9BYN7	854 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RAB6C	Q9H0N0	254 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DDX56	Q9NY93	547 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TAS2R1	Q9NYW7	299 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	AGO2	Q9UKV8	859 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	EMCN	Q9ULC0	261 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	USP3	Q9Y6I4	520 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TRPM7	Q96QT4	1865 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	EXOC1L	A0A1B0GW35	172 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MAGEC1	O60732	1142 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ALDH1A2	O94788	518 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NR3C2	P08235	984 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RPSA	P08865	295 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SSTR1	P30872	391 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ARRB2	P32121	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RFC1	P35251	1148 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	MAGEA12	P43365	314 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RAD23B	P54727	409 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CDK16	Q00536	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SF3A3	Q12874	501 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TAF5	Q15542	800 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SLC9A4	Q6AI14	798 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PHLDB2	Q86SQ0	1253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	LONP2	Q86WA8	852 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C4orf33	Q8N1A6	199 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SHKBP1	Q8TBC3	707 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ISL2	Q96A47	359 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	APOPT1	Q96IL0	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	IFT74	Q96LB3	600 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RAB3IP	Q96QF0	476 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RMDN3	Q96TC7	470 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PDZD7	Q9H5P4	517 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ZDHHC7	Q9NXF8	308 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	DYNC1LI1	Q9Y6G9	523 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	SPDYE5	A6NIY4	337 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	TBX10	O75333	385 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ERBB2	P04626	1255 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	RDX	P35241	583 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	ACOT2	P49753	483 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTSC-208	ENST00000533897	GPS1	Q13098	491 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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