RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531226.5

PACSIN3-208, Transcript of protein kinase C and casein kinase substrate in neurons 3, humanhuman

TSL 5

Gene PACSIN3, Length 654 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3-208ENST00000531226 ANXA13P27216 316 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 CDC25CP30307 473 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 MTMR3Q13615 1198 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TEAD2Q15562 447 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 MAN2A1Q16706 1144 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 PAQR9Q6ZVX9 377 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 MTSS1LQ765P7 747 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 FUKQ8N0W3 1084 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 EHBP1Q8NDI1 1231 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 SMARCD1Q96GM5 515 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 C8orf48Q96LL4 319 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 MED10Q9BTT4 135 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 DNAI2Q9GZS0 605 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM49BQ9NUQ9 324 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM30AQ9NV96 361 aa20.21■□□□□ 0.83
PACSIN3-208ENST00000531226 F8VP50 259 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 CCDC130P13994 396 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 CACNA2D1P54289 1103 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ZXDAP98168 799 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TYRO3Q06418 890 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 C12orf29Q8N999 325 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 RSAD2Q8WXG1 361 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 FGF14Q92915 247 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 MYRFLQ96LU7 910 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 GCNAQ96QF7 691 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ATXN3LQ9H3M9 355 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 GCNT4Q9P109 453 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 UXTQ9UBK9 157 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 MAGED2Q9UNF1 606 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 NUMBLQ9Y6R0 609 aa20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNJ18B7U540 433 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TDGQ13569 410 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNJ12Q14500 433 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ZNF394Q53GI3 561 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 PARM1Q6UWI2 310 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 PPM1KQ8N3J5 372 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 UBR7Q8N806 425 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC2A14Q8TDB8 520 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 EDAQ92838 391 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR88Q9GZN0 384 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 DMAP1Q9NPF5 467 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 KRT82Q9NSB4 513 aa20.19■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 GTPBP10A4D1E9 387 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 F11P03951 625 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 RAD23BP54727 409 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGAP15Q53QZ3 475 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 DENND5BQ6ZUT9 1274 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM150AQ86TG1 271 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ARHGEF19Q8IW93 802 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 UBALD2Q8IYN6 164 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC4A11Q8NBS3 891 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ST13P5Q8NFI4 369 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 CYFIP2Q96F07 1278 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TMEM176AQ96HP8 235 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ASB16Q96NS5 453 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 HNRNPABQ99729 332 aaKnown RBP20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.18■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TADA3O75528 432 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 AP1G2O75843 785 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ADORA2BP29275 332 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 CYP4F8P98187 520 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 GCNT1Q02742 428 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TCP11X2Q5H9J9 407 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM78AQ5JUQ0 283 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 MIIPQ5JXC2 388 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 STXBP5Q5T5C0 1151 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 GPR158Q5T848 1215 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 CDKAL1Q5VV42 579 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 GBP6Q6ZN66 633 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 SLC44A3Q8N4M1 653 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSCAN18Q8TBC5 510 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 KAT5Q92993 513 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ZSWIM3Q96MP5 696 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 KCNK16Q96T55 309 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 CRACR2AQ9BSW2 395 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TTLL2Q9BWV7 592 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 SMOC2Q9H3U7 446 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 CSNK1G1Q9HCP0 422 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 EHD2Q9NZN4 543 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TICRRQ7Z2Z1 1910 aa20.17■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 FAM200BP0CF97 657 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 FCARP24071 287 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 USP46P62068 366 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 MYL5Q02045 173 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 SIGLEC14Q08ET2 396 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 VWA3BQ502W6 1294 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 TRIM65Q6PJ69 517 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 ZMIZ2Q8NF64 920 aa20.16■□□□□ 0.82
PACSIN3-208ENST00000531226 SMARCD2Q92925 531 aa20.16■□□□□ 0.82
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