RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530727.5

PTPRC-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 1,962 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-214ENST00000530727 PLSCR1O15162 318 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 ORC4O43929 436 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 CFBP00751 764 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 A1BGP04217 495 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 C1SP09871 688 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 HSPA6P17066 643 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 CTSSP25774 331 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 SCNN1GP51170 649 aa4.77□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 PTH1RQ03431 593 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 SNX33Q8WV41 574 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 TAF1LQ8IZX4 1826 aa4.77□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 GZMKP49863 264 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 CPPED1Q9BRF8 314 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 DNAJC28Q9NX36 388 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 MTX1Q13505 466 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 GPR52Q9Y2T5 361 aa4.76□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 RPTORQ8N122 1335 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 NPIPB8E9PQR5 432 aa4.75□□□□□ -1.65
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PTPRC-214ENST00000530727 PHF2O75151 1096 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 STARD3NLO95772 234 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 HSD3B1P14060 373 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 GPR3P46089 330 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 APBA1Q02410 837 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 ITPK1Q13572 414 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 GCKRQ14397 625 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 LSM12Q3MHD2 195 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
PTPRC-214ENST00000530727 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
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