RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524393.5

RBBP4-215, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 3

Gene RBBP4, Length 583 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-215	ENST00000524393	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CCNE1	P24864	410 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PIK3CA	P42336	1068 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PDE6C	P51160	858 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	VAMP7	P51809	220 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	LRRC32	Q14392	662 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PPP2R5D	Q14738	602 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	NFIL3	Q16649	462 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC142	Q17RM4	750 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SGSM1	Q2NKQ1	1148 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TXNDC8	Q6A555	127 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	INTS8	Q75QN2	995 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TMEM150A	Q86TG1	271 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	MON1A	Q86VX9	555 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	RALGPS2	Q86X27	583 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PLEKHO2	Q8TD55	490 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TAF4B	Q92750	862 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CLDN23	Q96B33	292 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TNIP3	Q96KP6	325 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SPATA17	Q96L03	361 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	ELOVL4	Q9GZR5	314 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SMG9	Q9H0W8	520 aa	Known RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	GZF1	Q9H116	711 aa	Predicted RBP	13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	XYLT2	Q9H1B5	865 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SEMA4A	Q9H3S1	761 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TRPC7	Q9HCX4	862 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	FBXO4	Q9UKT5	387 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PATJ	Q8NI35	1801 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TRAV19	A0A0A6YYK7	116 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PRR23A	A6NEV1	266 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	ARNTL	O00327	626 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SMC2	O95347	1197 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CKM	P06732	381 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	USP17L7	P0C7H9	530 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SP9	P0CG40	484 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	DLG4	P78352	724 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	ZACN	Q401N2	412 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SCARA5	Q6ZMJ2	495 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	DENND5B	Q6ZUT9	1274 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM186B	Q8IYM0	893 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	ZFYVE19	Q96K21	471 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	GTPBP4	Q9BZE4	634 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	DNAI2	Q9GZS0	605 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TRPM5	Q9NZQ8	1165 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	OBSL1	O75147	1896 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SPECC1L-ADORA2A	F8WAN1	911 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PPP3CC	P48454	512 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	AMPD2	Q01433	879 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CSTF1	Q05048	431 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	FAM160A1	Q05DH4	1040 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	ENPEP	Q07075	957 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	ADAM9	Q13443	819 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PNOC	Q13519	176 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	ZNF528	Q3MIS6	628 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SV2A	Q7L0J3	742 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	FMR1NB	Q8N0W7	255 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TTC16	Q8NEE8	873 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TTC8	Q8TAM2	541 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	USP13	Q92995	863 aa	Predicted RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	EXOC4	Q96A65	974 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	C8orf48	Q96LL4	319 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	GSDMA	Q96QA5	445 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	MED10	Q9BTT4	135 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	DPEP3	Q9H4B8	488 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	LMAN1L	Q9HAT1	526 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	GTSE1	Q9NYZ3	720 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	DENND4C	Q5VZ89	1909 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393		F8VP50	259 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	STX10	O60499	249 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TADA3	O75528	432 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	AKAP3	O75969	853 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	VNN1	O95497	513 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PFKL	P17858	780 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CTH	P32929	405 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	RAP1GAP	P47736	663 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SOX9	P48436	509 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CDH8	P55286	799 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	NOP14	P78316	857 aa	Known RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	PDGFRL	Q15198	375 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SMARCE1	Q969G3	411 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	LRRC3B	Q96PB8	259 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	SLITRK1	Q96PX8	696 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	TSG101	Q99816	390 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CHRD	Q9H2X0	955 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	CCL26	Q9Y258	94 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393		R4GN57	208 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RBBP4-215	ENST00000524393	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBBP4-215	ENST00000524393	PTPRD	P23468	1912 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBBP4-215	ENST00000524393	SHISA7	A6NL88	538 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RBBP4-215	ENST00000524393	CETN3	O15182	167 aa		13.39	□□□□□ -0.27

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