RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522928.1

CLVS1-209, Transcript of clavesin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CLVS1, Length 464 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLVS1-209ENST00000522928 SLIT1O75093 1534 aa4.77□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP23Q9P227 1491 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 TRGV11A0A075B6L2 103 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 UNC5CO95185 931 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 LMNAP02545 664 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ERBB2P04626 1255 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 BLOC1S1P78537 153 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SP2Q02086 613 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 FPGSQ05932 587 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 IDI1Q13907 227 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 GBX1Q14549 363 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MINDY4Q4G0A6 757 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 VPS53Q5VIR6 699 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 FMNL3Q8IVF7 1028 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 COLGALT2Q8IYK4 626 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 AOPEPQ8N6M6 819 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SMOQ99835 787 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 BHMT2Q9H2M3 363 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 STK32BQ9NY57 414 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 HESX1Q9UBX0 185 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 NEU2Q9Y3R4 380 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MAP3K1Q13233 1512 aa4.76□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 CEP162Q5TB80 1403 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ADM5C9JUS6 153 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 M0QYG6 137 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 TOR1BO14657 336 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ERC2O15083 957 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 TBX3O15119 743 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 HRGP04196 525 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 KITP10721 976 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 PPP3CBP16298 524 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 NPTX2P47972 431 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SIM1P81133 766 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MPP3Q13368 585 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 PRR16Q569H4 304 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 FAM160B1Q5W0V3 765 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MAEAQ7L5Y9 396 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 DAAM2Q86T65 1068 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ZC3H8Q8N5P1 291 aaKnown RBP eCLIP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 FAM46DQ8NEK8 389 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 BRIX1Q8TDN6 353 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 KBTBD7Q8WVZ9 684 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 CASS4Q9NQ75 786 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SERHLQ9NQF3 203 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 C1orf112Q9NSG2 853 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 OBP2AQ9NY56 170 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 TESQ9UGI8 421 aaKnown RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 EFCAB6Q5THR3 1501 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 KANK1Q14678 1352 aa4.75□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 RGS12O14924 1447 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 A0A087WWL8 130 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 YY2O15391 372 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 C1QL1O75973 258 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 RHOP08100 348 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 PCSK6P29122 969 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 FOLR3P41439 243 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 GCLCP48506 637 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 PTH2RP49190 550 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SLC11A2P49281 568 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 NDUFV1P49821 464 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 UCP3P55916 312 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 GPSM2P81274 684 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MXRA7P84157 204 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ZIK1Q3SY52 487 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 CCDC157Q569K6 752 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SNX19Q92543 992 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 TIFAQ96CG3 184 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 SLC46A1Q96NT5 459 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 OSBPL9Q96SU4 736 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 HEPHQ9BQS7 1158 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 DKK3Q9UBP4 350 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ARHGEF5Q12774 1597 aa4.74□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 ADGRA2Q96PE1 1338 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 FGD6Q6ZV73 1430 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 MROH1Q8NDA8 1641 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 TMEM233B4DJY2 109 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 TPP1O14773 563 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 PDHA1P08559 390 aa4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
CLVS1-209ENST00000522928 EN2P19622 333 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms