RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522702.5

FAM49B-222, Transcript of family with sequence similarity 49 member B, human

TSL 4

Gene FAM49B, Length 544 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM49B-222	ENST00000522702	HEPH	Q9BQS7	1158 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	WASH6P	Q9NQA3	447 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	AJAP1	Q9UKB5	411 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PCDHA1	Q9Y5I3	950 aa		4.58	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	COL4A3	Q01955	1670 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ZMYM3	Q14202	1370 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	NPC1	O15118	1278 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ANP32C	O43423	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ARIH2	O95376	493 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ATP1A3	P13637	1013 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SERPINF1	P36955	418 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FLT3LG	P49771	235 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CTXN1	P60606	82 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CREM	Q03060	361 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MRPL49	Q13405	166 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CCDC184	Q52MB2	194 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	KHDC1L	Q5JSQ8	128 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MFSD14B	Q5SR56	506 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	NAIF1	Q69YI7	327 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	BEND5	Q7L4P6	421 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PLXDC1	Q8IUK5	500 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	OR10H5	Q8NGA6	315 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MDM1	Q8TC05	714 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ASB12	Q8WXK4	309 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SUCLG2	Q96I99	432 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	NUDT16L1	Q9BRJ7	211 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PYM1	Q9BRP8	204 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SENP6	Q9GZR1	1112 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PLEKHA5	Q9HAU0	1116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SERHL	Q9NQF3	203 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM140	Q9NV12	185 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CAMSAP3	Q9P1Y5	1249 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MYO1A	Q9UBC5	1043 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MAN2B2	Q9Y2E5	1009 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ACTL7A	Q9Y615	435 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SCRIB	Q14160	1630 aa		4.57	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ANKRD18B	A2A2Z9	1011 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	KIAA0355	O15063	1070 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	THAP12	O43422	761 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SCAF4	O95104	1147 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TNFRSF6B	O95407	300 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CKMT1A	P12532	417 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	IL2RB	P14784	551 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	LAG3	P18627	525 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	NR4A1	P22736	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PTPN7	P35236	360 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	KRT20	P35900	424 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ALDH1A3	P47895	512 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	GZMK	P49863	264 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SPARCL1	Q14515	664 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM133B	Q5BKY9	247 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM47A	Q5JRC9	791 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	C1QL3	Q5VWW1	255 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	AFMID	Q63HM1	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	OTUD7B	Q6GQQ9	843 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PDXDC1	Q6P996	788 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FASTKD5	Q7L8L6	764 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	STYX	Q8WUJ0	223 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	LRRC46	Q96FV0	321 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	MSLNL	Q96KJ4	702 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	P2RX7	Q99572	595 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CHCHD6	Q9BRQ6	235 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	HELLS	Q9NRZ9	838 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	STK32B	Q9NY57	414 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SLC23A1	Q9UHI7	598 aa		4.56	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702		A0A1W2PRQ8	180 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	GRID2IP	A4D2P6	1211 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	GRXCR1	A8MXD5	290 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702		B4E171	279 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TISP43	B9A030	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702		B9A039	149 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	F2RL2	O00254	374 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	HNRNPDL	O14979	420 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ORC4	O43929	436 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TMCC2	O75069	709 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	SOAT2	O75908	522 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	STC2	O76061	302 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	ANXA2	P07355	339 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	FTH1P19	P0C7X4	201 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	CDK4	P11802	303 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	HK1	P19367	917 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	EN2	P19622	333 aa	Predicted RBP	4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	PRDX5	P30044	214 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	TSPAN7	P41732	249 aa		4.55	□□□□□ -1.68
FAM49B-222	ENST00000522702	KCNJ5	P48544	419 aa		4.55	□□□□□ -1.68

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