RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520053.1

STK3-208, Transcript of serine/threonine kinase 3, human

TSL 4

Gene STK3, Length 577 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STK3-208	ENST00000520053	FAM50A	Q14320	339 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	IQCB1	Q15051	598 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	L1TD1	Q5T7N2	865 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SHC4	Q6S5L8	630 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SERPINA13P	Q6UXR4	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ABHD11	Q8NFV4	315 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	TMEM79	Q9BSE2	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	POC1B-GALNT4	F8VUJ3	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053		H7C1Q1	480 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SLC16A6	O15403	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	DTNB	O60941	627 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	USP1	O94782	785 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	UNC5C	O95185	931 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ZRANB2	O95218	330 aa	Known RBP eCLIP	4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CYP2A6	P11509	494 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	TYR	P14679	529 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	PDC	P20941	246 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CCND1	P24385	295 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	IL1R2	P27930	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	GALNT4	Q8N4A0	578 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	TERB1	Q8NA31	727 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	PUS7	Q96PZ0	661 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	MTMR4	Q9NYA4	1195 aa		4.88	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ADAM10	O14672	748 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	HDC	P19113	662 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ATP5F1	P24539	256 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	MAP2K6	P52564	334 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	LINC00205	P59089	165 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	E2F2	Q14209	437 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ZNF268	Q14587	947 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	TBC1D25	Q3MII6	688 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	DEPDC1	Q5TB30	811 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ZDHHC17	Q8IUH5	632 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ADAMTS15	Q8TE58	950 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	FAM118B	Q9BPY3	351 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CIPC	Q9C0C6	399 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	PNPO	Q9NVS9	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	NDRG4	Q9ULP0	352 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SCAF8	Q9UPN6	1271 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	MRPS17	Q9Y2R5	130 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CCDC187	A0A096LP49	1063 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	UBE2Q2L	H0YL09	131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053		H3BUI4	141 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	FGB	P02675	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	FPR3	P25089	353 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	KCNJ5	P48544	419 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	RENBP	P51606	427 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	AMOT	Q4VCS5	1084 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CCDC157	Q569K6	752 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	MRPL10	Q7Z7H8	261 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	BRIX1	Q8TDN6	353 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ZC3H10	Q96K80	434 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	LENG8	Q96PV6	779 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ADGRE3	Q9BY15	652 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	TMX1	Q9H3N1	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SPC25	Q9HBM1	224 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	TNKS	O95271	1327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	FCHO1	O14526	889 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ERC2	O15083	957 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	GRP	P07492	148 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CHRM5	P08912	532 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	KRTAP5-9	P26371	169 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SOX8	P57073	446 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	DPY19L3	Q6ZPD9	716 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	NSMCE1	Q8WV22	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	EFHD1	Q9BUP0	239 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	LRP12	Q9Y561	859 aa		4.85	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	FNDC1	Q4ZHG4	1894 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	AP4M1	O00189	453 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	DSCR3	O14972	297 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	TJP3	O95049	919 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	VNN1	O95497	513 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	DLD	P09622	509 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SCP2	P22307	547 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	ADORA2A	P29274	412 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CCKAR	P32238	428 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	PDE6C	P51160	858 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	PLS1	Q14651	629 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	RBMS2	Q15434	407 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	USP45	Q70EL2	814 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SLC15A3	Q8IY34	581 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	PIGO	Q8TEQ8	1089 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	OSCP1	Q8WVF1	389 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	SOCS4	Q8WXH5	440 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	CUL5	Q93034	780 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	FAM167A	Q96KS9	214 aa		4.84	□□□□□ -1.63
STK3-208	ENST00000520053	MOGAT1	Q96PD6	335 aa		4.84	□□□□□ -1.63

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