RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000518852.5

PPP3CC-204, Transcript of protein phosphatase 3 catalytic subunit gamma, human

TSL 2 BASIC

Gene PPP3CC, Length 1,598 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP3CC-204	ENST00000518852	TMEM253	P0C7T8	217 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	FAM200B	P0CF97	657 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	NPR3	P17342	541 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	RPL17	P18621	184 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	MMP8	P22894	467 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	ARHGAP25	P42331	645 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	ERVK-21	P61565	698 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	GPR17	Q13304	367 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	NFE2	Q16621	373 aa	Predicted RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	C4orf50	Q6ZRC1	276 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	CLEC20A	Q6ZU45	233 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	C11orf70	Q9BRQ4	267 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	MTUS1	Q9ULD2	1270 aa		27.91	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	BEST1	O76090	585 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	CPB1	P15086	417 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	ABCB4	P21439	1286 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	CACNA2D1	P54289	1103 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	PTPN14	Q15678	1187 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	RAB30	Q15771	203 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	SPPL3	Q8TCT6	385 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	CPXM1	Q96SM3	734 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	SMO	Q99835	787 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	THAP2	Q9H0W7	228 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	CCP110	O43303	1012 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	CAPN15	O75808	1086 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	AP1G2	O75843	785 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	ABL1	P00519	1130 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	BDNF	P23560	247 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	DNAJB2	P25686	324 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	ARPP19	P56211	112 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	ROR1	Q01973	937 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	C1QBP	Q07021	282 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	CFAP221	Q4G0U5	840 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	C2CD6	Q53TS8	623 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	PMF1	Q6P1K2	205 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	MMS22L	Q6ZRQ5	1243 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	ZMIZ2	Q8NF64	920 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	FUBP3	Q96I24	572 aa	Known RBP eCLIP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	C11orf84	Q9BUA3	381 aa	Predicted RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	NKX2-4	Q9H2Z4	354 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	MRPL17	Q9NRX2	175 aa	Known RBP	27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	ADAM22	Q9P0K1	906 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	TJP2	Q9UDY2	1190 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	TRIM10	Q9UDY6	481 aa		27.9	■■■□□ 2.06
PPP3CC-204	ENST00000518852	WDR27	A2RRH5	827 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	MTMR11	A4FU01	709 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	XPO1	O14980	1071 aa	Known RBP	27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	VNN2	O95498	520 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	OR1D2	P34982	312 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	PLA2G4A	P47712	749 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	UBE3A	Q05086	875 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	ERICH1	Q86X53	443 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	STK32A	Q8WU08	396 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	ARHGEF26	Q96DR7	871 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	VCPIP1	Q96JH7	1222 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	NOX5	Q96PH1	765 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	RXFP1	Q9HBX9	757 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	MSRA	Q9UJ68	235 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	ATG2A	Q2TAZ0	1938 aa		27.89	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	DNAJB1	P25685	340 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	RPL34	P49207	117 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	SMARCB1	Q12824	385 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	RNF19B	Q6ZMZ0	732 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	POF1B	Q8WVV4	589 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	CTNNBL1	Q8WYA6	563 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	ZNF653	Q96CK0	615 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	PGLYRP2	Q96PD5	576 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	SLC4A5	Q9BY07	1137 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	APOBEC3C	Q9NRW3	190 aa	Known RBP eCLIP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	ABI2	Q9NYB9	513 aa	Predicted RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	FNIP2	Q9P278	1114 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	SSX2IP	Q9Y2D8	614 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	PCDHB5	Q9Y5E4	795 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	NCAN	O14594	1321 aa		27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	27.88	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	MSN	P26038	577 aa	Known RBP	27.87	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	GABRB2	P47870	512 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	RGS7	P49802	495 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	MAP3K7CL	P57077	242 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	ERVFC1	P60507	584 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	KIF5A	Q12840	1032 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	TRIM11	Q96F44	468 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	ABCB6	Q9NP58	842 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	LZTFL1	Q9NQ48	299 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		27.87	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	ATMIN	O43313	823 aa	Predicted RBP	27.86	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	GABBR2	O75899	941 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	ERBB2	P04626	1255 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	CALB1	P05937	261 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	MYBL1	P10243	752 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	CYP2F1	P24903	491 aa		27.86	■■■□□ 2.05
PPP3CC-204	ENST00000518852	SLC8A3	P57103	927 aa		27.86	■■■□□ 2.05

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